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Single nucleus
RNA-seq of the nucleus
basalis of Meynert
Presentado por Gabriel Ramírez-Vilchis
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Cómo empezó mi estancia en el lab…
LCG, 2021 Curso de
RNAseq, 2025
Estancia remota,
2025-Actual
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Curso de scRNA-seq
https://www.youtube.com/playlist?list=PLwa0ZAE6DJg6j0QEgtgzQwi5xsz6po22E
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Enfermedad de Alzheimer (AD)
▪Causa principal de demencia
globalmente en individuos
mayores de 65 años de
edad.
▪Aún no se conocen los genes
causales y los mecanismos
que participan en la
patogénesis del AD.
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APOE
▪Papel central en el
transporte y metabolismo
de lípidos.
▪Se asocia con
enfermedades
cardiovasculares,
accidentes
cerebrovasculares y
neurodegeneración..
(Crespo-Lopez, 2018)
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Núcleo basal de Meynert (NbM)
• Es uno de los
principales núcleos
colinérgicos del
prosencéfalo humano.
• Presenta una pérdida
de aproximadamente
50% de neuronas
colinérgicas en etapas
medias y tardías del AD. (Differences and Implications of Animal Models
for the Study of Alzheimerʼs Disease, s/f)
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Objetivos del proyecto
▪Estudiar la biología molecular de las células NbM en el
contexto del riesgo genético de AD en individuos
presintomáticos que entran en la edad de riesgo.
▪Definir dos características centrales de cada genotipo
y ascendencia: 1) composición celular y 2) expresión
genética diferencial.
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Single-nucleus RNA-sequencing
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El papel de la bioinformática
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El papel de la bioinformática
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Lo que he aprendido
▪Teoría de análisis de single-cell RNAseq
▪Trabajo colaborativo a distancia
▪Gestión de proyectos en GitHub y servidor
▪Conocer estrategias de trabajo en labs de
bioinformática
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¡GRACIAS!
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Referencias
▪ Crespo-Lopez, M. E. (2018). Role for apolipoprotein E in neurodegeneration and
mercury intoxication. Frontiers in Bioscience, 10(1), 229–241.
https://doi.org/10.2741/e819
▪ Differences and Implications of Animal Models for the Study of Alzheimerʼs Disease.
(s/f). Http://Www.Eurekaselect.Com. Recuperado el 11 de febrero de 2026, de
http://www.eurekaselect.com/chapter/12526