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なぜJupyter Labをベースにするか
• Rが使える
• パッケージのインストールにバリエーション
• ソース、Ubuntuバイナリ、(bio)conda (r-xxxx, bioconductor-xxxx)
• vignetteの表示が変 / df_Summaryの表示が崩れる
• もちろんPythonも使えGPUベースの深層学習が利用できる
• Rpy2を使うとRとPythonのコードがセル単位で同一ページに混在可
• WebブラウザがあればJupyter Labが使える
• Jupyter Labでコンソールが使える
• ブラウザ利用のみ許可されたシンクライアントでの利用など
• Singularity起動のオプションで対話的か否かを切り替え可能
• スパコンのジョブシステムでバッチ処理できる
2023/12/16 Rの研究集会2023@統計数理研究所 6