Rの基礎8 作図 2020/8/14 Ver. 1.0

Rと作図 Rはパッケージなしでも作図機能が豊富 ＊http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r/47.html のスクリプトを走らせただけ

基本の散布図: plot plot関数で散布図などを書くことができる plot(x, y)が基本的な使い方となる

散布行列: pairs 行列・データフレームの散布図作成に利用できる pairs(data.frame)で各列間の相関を調べられる ＊相関係数はcor(data.frame)で調べられる

ヒストグラム: hist hist関数でヒストグラム（データの分布）を描画できる hist(vector)が基本の形となる

箱ひげ図: boxplot boxplot関数で箱ひげ図（データの分布）を描画できる 箱ひげ図: https://ja.wikipedia.org/wiki/%E7%AE%B1%E3%81%B2%E3%81%92%E5%9B%B3 boxplot(vector)が基本の形となる

Rの基礎作図の問題点 複雑な描画をするとスクリプトがわかりにくくなる • 高次作図関数と低次作図関数を組み合わせる • plotを重ね合わせる • 描画エリアを分割する 等々の複雑な操作が必要

ggplot2パッケージ 現代Rでの作図のデファクト・スタンダード やや複雑だが、きれいなグラフが簡単に書ける ＊ggplot2 reference: https://ggplot2.tidyverse.org/reference/

ggplot2を使う: ライブラリを読み込む ggplot2 もしくは tidyverse を読み込む • tidyverseにはggplot2が含まれる • tidyverseの他のパッケージをグラフ作成に利用できる

ggplot2の基礎 ggplot関数を使用する ggplot(data.frame, aes(…)) • ggplotの第一引数はデータフレーム • 第二引数にaes関数を置く ＊aes: aesthetic、「美的な」の略

ggplot2の基礎: aes関数 aes関数には、x・y軸の指定、色の指定などを入力する irisデータフレームを作図に使う x軸はPetal.Lengthの列 y軸はSepal.Lengthの列 線の色はSpeciesの列 棒グラフの中などはSpeciesの列 で記述する ＊iris: アヤメの花弁、がく片の長さのデータセット。Rでは始めから利用でき、よく用いられる

ggplot2の基礎: geom関数 グラフの形はgeom関数で決定する geom_point() geom_line() geom_bar() geom_boxplot() geom_density() geom_quantile() geom_errorbar() geom_linerange() 点グラフ（散布図） 線グラフ 棒グラフ 箱ひげ図 確率密度 回帰（四分位幅あり） エラーバー エラーバー（横線なし）

ggplot2の基礎: geom関数の使い方 ggplot関数と＋でつなぐ

まとめ • Rには作図のための関数が準備されている • ggplot2が作図のスタンダードとなっている • ggplot(data.frame, aes())が基本の形 • geom関数でグラフの形を決める