Slide 1
Slide 1 text
Int
Roduction
2019.09.29
kilometer00
& DemonstRation
#81
Slide 2
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Who！？
Slide 3
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Who！？
名前： 三村 @kilometer
職業： ポスドク (こうがくはくし)
専⾨： ⾏動神経科学(霊⻑類)
脳イメージング
医療システム⼯学
R歴： ~ 10年ぐらい
流⾏: 季節感
Slide 4
Slide 4 text
2018.10.20 Tokyo.R #73
BeginneR Session – Visualization & Plot
2019.01.19 Tokyo.R #75
BeginneR Session – Data pipeline
2019.03.02 Tokyo.R #76
BeginneR Session – Data pipeline
2019.04.13 Tokyo.R #77
BeginneR Session – Data analysis
2019.05.25 Tokyo.R #78
BeginneR Session – Data analysis
2019.06.29 Tokyo.R #79
BeginneR Session – 確率の基礎
2019.07.27 Tokyo.R #80
R Interface to Python
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Slide 5 text
Before After
BeginneR Session
BeginneR BeginneR
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BeginneR Advanced Hoxo_m
If I have seen further it is by standing on
the shoulders of Giants.
-- Sir Isaac Newton, 1676
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#81
the✨Shiny✨ Speakers
@kubochi_ukyo
@flaty13
@y__mattu
@igjit
@okiyuki99
@kashitan
@kos59125
@Np_Ur_ @kyyonko
@hoxo_m
@ao T.Ikeda
2019.09.28
Slide 8
Slide 8 text
R is a free software environment
for statistical computing and graphics.
https://www.r-project.org/
Slide 9
Slide 9 text
No content
Slide 10
Slide 10 text
No content
Slide 11
Slide 11 text
No content
Slide 12
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を、始めたいんだけど。
私もそろそろ
ぱそこん
できるんでしょ？教えてよ。
ぱそこん
いいけど、 で何がしたいの？
ぱそこん って何でもできるんでしょ？
でも、どうしたらいいか分かんないんだ。
⼀昔前
Slide 13
Slide 13 text
を、始めたいんだけど。
私もそろそろ
じんこう
ちのー
できるんでしょ？教えてよ。
いいけど、 で何がしたいの？
って何でもできるんでしょ？
でも、どうしたらいいか分かんないんだ。
最近
じんこう
ちのー
じんこう
ちのー
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を、始めたいんだけど。
私もそろそろ
できるんでしょ？教えてよ。
いいけど、 で何がしたいの？
って何でもできるんでしょ？
でも、どうしたらいいか分かんないんだ。
Slide 15
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を、始めたいんだけど。
私もそろそろ
できるんでしょ？教えてよ。
いいけど、 で何がしたいの？
って何でもできるんでしょ？
でも、どうしたらいいか分かんないんだ。
Slide 16
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Input
Output
Do NOT start from here
Slide 17
Slide 17 text
Input
Output
Do NOT start from here
Whatever
…
Slide 18
Slide 18 text
Input
Output
Do NOT start from here
Whatever
…
1
2
3
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R is a free software environment
for statistical computing
and graphics.
https://www.r-project.org/
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Input
Output
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Integrated Development Environment
RStudio https://www.rstudio.com/
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Integrated Development Environment
RStudio https://www.rstudio.com/
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RStudio
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Projects
RStudio
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File > New Project… > New Directory > New Project
hogehoge
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hogehoge
~/Documents/R
hogehoge.Rproj
.Rproj.user
Project Root Directory
Double click!!
.RData
.Rhistory
Auto saved
project information
Open project
New!!
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~/Documents/R
project1
project2
project3
project4
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Cmd+Shift+N
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スクリプト コンソール
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実⾏結果が出る
ココに書く
選んで実⾏
Cmd+Enter
スクリプト コンソール
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demo
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代⼊演算⼦ (Assignment Algebra)
A <- B
# B to A
A -> B
# A to B
A = B
# B to A
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ブール演算⼦ Boolean Algebra
A == B A != B
George Boole
1815 - 1864
A | B A & B
A %in% B
# equal to # not equal to
# or # and
# is A in B?
wikipedia
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"a" != "b"
# is A in B?
ブール演算⼦ Boolean Algebra
[1] TRUE
1 %in% 10:100
# is A in B?
[1] FALSE
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関数 Function
lift
ロボヨロ <- function(ロボ, コップ, ⽜乳){
ロボコップ <- lift(ロボ, コップ)
出⼒ <- pour(ロボコップ, ⽜乳)
return(出⼒)
}
引数1 引数2 引数3
関数名
pour
ロボ(⼊⼒) ロボコップ 出⼒
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Input
Output
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packages
you
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Input
Output
packages
Data Pipeline
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No content
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Slide 40 text
No content
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No content
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Output
Input
Input
Data Pipeline
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Slide 43 text
Output
Input
Input
Data Pipeline
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Slide 44 text
Output
Input
Input
Data Pipeline
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Data Pipeline
readable
coding
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Programing
Write
Run
Read
Think
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Run!!!
https://www.amazon.co.jp/dp/B00Y0UI990/
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Programing
Write
Run
Read
Think
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Programing
Write
Run
Read
Think
coding style
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The tidyverse style guide
https://style.tidyverse.org/
"Good coding style is like correct punctuation:
you can manage without it, butitsuremakesthingseasiertoread."
Google's R Style Guide
https://style.tidyverse.org/
"The goal of the R Programming Style Guide is to make our
R code easier to read, share, and verify."
R coding style guides
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The tidyverse style guide
https://style.tidyverse.org/
"Good coding style is like correct punctuation:
you can manage without it, butitsuremakesthingseasiertoread."
Google's R Style Guide
https://style.tidyverse.org/
"The goal of the R Programming Style Guide is to make our
R code easier to read, share, and verify."
R coding style guides
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Programing
Write
Run
Read
Think
Write
Run
Read
Think
Share
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Programing
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Programing
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Text Figure
Information
Intention
Data
decode
encode
feedback
Programing
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Shiny is an R package
that makes it easy to build
interactive web apps straight from R.
https://shiny.rstudio.com/
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Enjoy!!
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Bar DraDra