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論⽂を収集するクローリング機能
version 2020.06.01
Pubmedから以下のクエリでクローリングして論⽂を収集
1. 疾患カテゴリ名(対応するMeSH Term*)とモデルの名前の組み合わせ
例)Neurodevelopmental Disorders [MeSH Terms] x "Reinforcement learning”
→⾃動的に以下の2つのタグも付与される
2. ”Computational psychiatry”に合致する論⽂
タグの付け⽅は後述
* MeSH Term: Medical Subjest Headings の略で、 Pubmedで⽤いられている医学⽤語
の⾒出し
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キーワードを元に⾃動的にタグ付け
version 2020.06.01
● キーワード集を作成し類似するキーワードが含まれる論⽂にタグを付与
例)
Abstract
…this functional impairment of the inferior frontal gyrus in those at genetic risk of
bipolar disorder reflects the dysfunction of broader network dynamics underlying the
coordination of emotion perception and cognitive control.
Breakspear, Michael, et al. "Network dysfunction of emotional and cognitive processes in those at genetic risk of bipolar
disorder." Brain 138.11 (2015): 3427-3439.
対応するキーワード:Gene, genetic
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除外タグ選択機能の追加
version 2020.06.01
デフォルトで表示する軸にタグがついていない
論文(unspecified)が表示されない仕様
「データ駆動アプローチ」
識別関数
識別モデル
⼊⼒:脳・⽣体情報
出⼒:クラス(ラベル/確率)
⼿法:サポートベクターマシン、回帰など
例:疾患 or 健康?/再発予測
f
• 精神疾患に関する⼤規模データに対して、機械学習の⼿法を適⽤し、データ
のクラスタリングや識別モデルの開発を試みる。
version 2020.06.01 26
Demirci, Oguz, et al. "A review of challenges in the use of
fMRI for disease classification/characterization and a
projection pursuit application from a multi-site fMRI
schizophrenia study." Brain imaging and behavior 2.3
(2008): 207-226.