Slide 11
Slide 11 text
(参考)K-merの抽出
同様の処理でK-mer全てを抽出することができる
>>> rna = 'AUGGCCAUGGCGCCCAGAACUGAGAUCAAUAGUACCCGUAUUAACGGGUGA'
>>> [rna[n:n + 3] for n in range(0, len(rna)-2)]
['AUG', 'UGG', 'GGC', 'GCC', 'CCA', 'CAU', 'AUG', 'UGG', 'GGC',
'GCG', 'CGC', 'GCC', 'CCC', 'CCA', 'CAG', 'AGA', 'GAA', 'AAC',
'ACU', 'CUG', 'UGA', 'GAG', 'AGA', 'GAU', 'AUC', 'UCA', 'CAA',
'AAU', 'AUA', 'UAG', 'AGU', 'GUA', 'UAC', 'ACC', 'CCC', 'CCG',
'CGU', 'GUA', 'UAU', 'AUU', 'UUA', 'UAA', 'AAC', 'ACG', 'CGG',
'GGG', 'GGU', 'GUG', 'UGA']