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金灯台-产品与技术服务
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上海金灯台信息科技有限公司
January 16, 2014
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金灯台-产品与技术服务
上海金灯台信息科技有限公司
January 16, 2014
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Transcript
产品与技术服务 同济大学levis研究组 上海金灯台信息科技有限公司 2014年1月14日
提纲 • 产品 • 名老中医资源信息平台 • 中医数据挖掘工具平台 • 技术服务 •
中医四诊信息采集与分析 • 中医临床数据挖掘与建模 2
提纲 • 产品 • 名老中医资源信息平台 • 中医数据挖掘工具平台 • 技术服务 •
中医四诊信息采集与分析 • 中医临床数据挖掘与建模 3
[IJFIPM:You:2008, IGIBook:Li:2010] 4 上海市中医药科技 奖一等奖,2010 名老中医资源信息平台
5 名老中医资源信息平台—信息采集 [IJFIPM:You:2008, IGIBook:Li:2010] 5/49
6 名老中医资源信息平台—数据挖掘 6/49
名老中医资源信息平台 具体情况请参考另一个文档《名老中医资源信息平 台介绍.pdf》 7
提纲 • 产品 • 名老中医资源信息平台 • 中医数据挖掘工具平台 • 技术服务 •
中医四诊信息采集与分析 • 中医临床数据挖掘与建模 8
中医数据挖掘工具平台 9 可为企业进行定制
中医数据挖掘工具平台 研究算法适合数据特点 • 对每一个研究模块,根据其所属研究方向和数据具体特点 选择合适的算法进行分析挖掘 算 法 列 表 离散统计描述
连续统计描述 卡方检验 T检验 Apriori关联规则挖掘 Pearson相关分析 信息增益属性选择 线性回归属性选择
中医数据挖掘工具平台 挖掘结果可视化程度高,清楚易用 • 举例:关联规则可视化 if then 支持 度 置信 度
提升 度 湿热 质 痰湿 质 0.1 0.68 3.01 痰湿 质 湿热 质 0.1 0.47 3.01 气虚 质 阳虚 质 0.15 0.62 2.95 阳虚 质 气虚 质 0.15 0.74 2.95
中医数据挖掘工具平台 挖掘结果可视化程度高,清楚易用 • 举例:关键属性选择可视化 属性名称 信息增益得分 室内外温差较大 0.02 不喝或偶尔喝酒 0.02
经常吸烟 0.02 挑食 0.02 偏嗜冷、凉食 0.01 喜饮茶 0.01 不吸或偶尔吸烟 0.01 吸烟N年 0.01 …… ......
中医数据挖掘工具平台 挖掘结果可视化程度高,清楚易用 • 通俗的结果解释,并且分析结果可方便保存
中医数据挖掘工具平台 具体情况请参考另一个文档《中医数据挖掘工具平 台介绍.pdf》 14
提纲 • 产品 • 名老中医资源信息平台 • 中医数据挖掘工具平台 • 技术服务 •
中医四诊信息采集与分析 • 中医临床数据挖掘与建模 15
中医四诊信息采集与分析 望 舌、面 闻 味、声 问 症状 切 脉
望诊信息采集与分析 • 舌头自动分割【中国科学 2012】 • 鼻子自动分割【进行中】 • 面部光泽自动判别【ICPR 2012】 •
唇色自动判别【BMCCAM 2012】 • 不同环境下照片的颜色自动矫正【进行中】 17
望诊信息采集仪器 18
舌头自动分割 19
面部光泽自动判别 20
闻诊信息采集与分析 • 咳嗽音自动识别【 CCML 2013, ChinaSIP 2013】 • 日常录音中的自动识别出咳嗽音 •
和同济医院的合作 • 语音(音乐)情感自动识别【IJPRAI 2009, IJCIS 2012】 21
咳嗽音自动识别 22
咳嗽音自动识别 23
语音情感识别 24
问诊信息采集与分析 • 名老中医资源信息平台 • 中医数据挖掘工具平台 25
切诊信息采集与分析 • 目前没有深入工作 26
提纲 • 产品 • 名老中医资源信息平台 • 中医数据挖掘工具平台 • 技术服务 •
中医四诊信息采集与分析 • 中医临床数据挖掘与建模 27
中医临床数据挖掘与建模 1.中西医治疗甲流的疗效分析 2.脂肪肝核心方挖掘 3.冠心病症状-症状关系分析 4.冠心病特征选择分析 5.高血压自动辨证分型 28/49
1.中西医治疗甲流的疗效分析—数据介绍 46 attributes • 包括病人的基本信息、用药记录和疗效三类。 5967 patients • 剔除“姓名”,“患者入组顺序”,“是否纳入分析”。 •
剔除在剩余属性中存在缺失值的500个样本。 • 剔除“中医辨证”属性为5的错误样本1个。 29/49 分析基本情况中的各属性对疗效的影响; 分析各种药物之间的相互作用,及其对疗 效的影响。
30 3 0 / 4 9 •第1列为方,包括1.中 药治疗,2.对症治疗,3. 中药+对症治疗。 •第2列为证,包括1.风
热犯卫,2.热毒袭肺,3. 风寒束表,4.其他。 •第3列为发热缓解时间, 单位为小时。 •第4列为症状缓解时间, 单位为天。 1.中西医治疗甲流的疗效分析—数据概述
31 1.中西医治疗甲流的疗效分析—疗效指标 分类指标: •发热缓解时间是否小于或等于24小时; •症状缓解时间是否小于等于4天。 连续值指标: •以平均值、中位数以及根据分类指标确定 的有效率为指标。 31/49
32 1.中西医治疗甲流的疗效分析—评价指标 优势比概念:如果P是概率,则P/(1-P)就是优势,而 优势与优势的比值即为优势比。 这里,P为有效的概率: • OR值等于1,表示该因素与疗效没有关系; • OR值大于1,表示该因素对疗效有促进作用 •
OR值小于1,表示该因素对疗效有减弱作用。 32/49
33 1.中西医治疗甲流的疗效分析—分组比较 • 分析用药分组对发热缓解的影响 • 组1是中药,组2是西药,组3是中西医结合 • 中药组疗效最好,且有统计学意义 33/49 group
frhj.gr 1 2 3 FALSE 676 139 1839 TRUE 805 118 1889 Odds ratio 1 0.71 0.86 lower 95% CI 0.54 0.76 upper 95% CI 0.94 0.98 Chi-squared = 9.063 , 2 d.f., P value = 0.011 Fisher's exact test (2-sided) P value = 0.011
34 1.中西医治疗甲流的疗效分析 34/49 药物1 3 3 3 3 6 8
药物2 8 9 14 19 13 17 发热缓解平均值 44.27 43.69 30.43 55.13 41.71 39.57 发热缓解中位数 30 30 24 48 30 24 发热缓解有效率 0.3902 0.3906 0.7857 0.2813 0.4677 0.5946 注:药物1和药物2中一个是中药,一个是西药,例如3是退热药,14是双黄连制剂 • 分析特定中药和西药共用的疗效 • 一般地,中药和西药共用,疗效一般会下降 药物1 3 14 3 药物2 14 发热缓解平均值 45.10 26.91 30.43 发热缓解中位数 36 24 24 发热缓解有效率 0.3652 0.7429 0.7857
35 2.脂肪肝核心方挖掘 《张云鹏肝病学术经验集》六味: • 丹参、决明子、郁金、泽泻、海藻、荷叶 35 /49
2.脂肪肝核心方挖掘 不均衡学习下的关联规则与频率统计技术
37 2.脂肪肝核心方挖掘 • 《张云鹏肝病学术经验集》六味: • 丹参、决明子、郁金、泽泻、海藻、荷叶 • 数据挖掘得出八味: • 丹参、决明子、郁金、泽泻、莱菔子、连翘、海藻、
荷叶 37 /49 不均衡学习下 的关联规则与 频率统计技术
3.冠心病症状-症状关系分析 38/49
3.冠心病症状-症状关系分析 39/49 【Chinese Medicine 2012】
3.冠心病症状-症状关系分析 强相互作用的症状 40/49
4.冠心病关键症状选择分析 41 /49 HOML多标记包装式特征选择 [SciChina:Shao:2011]
4.冠心病关键症状选择分析 42 /49 症状筛选后,辨证模型性能明显提升 Average precision↑ ML- KNN BP- MLL
Rank- SVM MLNB- BASIC AVE SFFS 0.8027 0.7842 0.7254 0.7890 77.53% SFBS 0.8146 0.7882 0.7235 0.7087 75.87% MDDM 0.7856 0.7529 0.7842 0.7746 77.43% MEFS 0.7933 0.7318 0.7456 0.8231 77.35% HOML 0.8819 0.8533 0.8604 0.7443 83.50%
各证候预测精度 0% 10% 20% 30% 40% 50% 60% 70% 80%
90% 100% z1 z2 z3 z4 z5 z6 AP 证候 原始分类结果 特征选择结果 Pre dic atio n Acc ura cy 4.冠心病关键症状选择分析 症状筛选后,辨证模型性能明显提升 43 /49
4.冠心病关键症状选择分析 对中医辨证真正起作用的症状其实不多 44 /49 NUM FS SA GA SFFS SFBS
MDDM MEFS HOML 优 化 后 的 症 状 数目 19 23 4 38 5 32 20 [SciChina:Shao:2011]
5.高血压自动辨证分型 数据共有555份,其中样本中男性265例(占47.7℅, 平均年龄65.15±13.17),女性290例(占52.3℅, 平均年龄:65.24±13.82) 采集的问诊症状包括寒热、汗、头身胸腹、二便、 饮食口味、睡眠、情绪、妇女等八个维度,共125个 症状。 6个证候,包括 z1心气虚,z2心阳虚,z3心阴虚, z4气滞,z5痰浊,z6血瘀
45 /49 [BMCCAM:Liu:2010]
5.高血压自动辨证分型—多标记学习 46 评价准则 ML-kNN kNN RankSVM BPMLL Average Precision(%) 77.4±3.3
73.6±3.1 71.0±2.1 75.4±2.7 Coverage 3.31±0.31 3.44±0.30 3.69±0.28 3.36±0.33 Ranking Loss .283±.035 .386±.037 .419±.041 .311±.039 [BMCCAM:Liu:2010]
47 /46 [1]. eCAM, (2012), ID 837245 (SCI, IF=4.77) 5.高血压自动辨证分型—信息融合
结束 48