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JAWS SONIC 2020 HPC

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September 13, 2020
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JAWS SONIC 2020 HPC

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porcaro33

September 13, 2020
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Transcript

  1. ParallelClusterを使い倒してみる JAWS-UG HPC専⾨⽀部 ⼩林広志 @JAWS SONIC 2020

  2. Who Am I - Name : Hiroshi Kobayashi - Organization

    : [ JAWS-HPC, Cloud_Admin@storage_company, ] - Favorite services : [ AWSCLI, Batch, ParallelCluster, ] - Award : AWS Samurai 2017
  3. HPC専⾨⽀部紹介 • HPC = High Performance Computing • テーマ︓「クラウドでだれでもHPC」 •

    2015年8⽉設⽴ • 特徴 • ハードウェアの話が⼀番盛り上がりがち • たまにハンズオン • たまにAWS本社からの登壇者も • 開催17回、参加者総数648名
  4. What is ParallelCluster? • 流体計算、遺伝⼦解析、気象予測などの計算を⾏うLinux クラスターの管理ツール • シンプルなコンフィグファイルにクラスターの構成を記述して、 それを元に計算クラスターを作成・更新・削除 •

    AWS Batchへのジョブ投⼊も可能 • バックグラウンドで様々なAWSサービスが稼働 (CloudFormation, EC2, S3, DynamoDB, SQS, …etc ) • ジョブ投⼊に応じてオートスケールする計算機で queue待ち無しサイコー︕
  5. はじめの⼀歩 • 管理ノードにParallelClusterをインストール • アプリケーションやライブラリの追加はMaster Nodeにsshして⼿作業 • やったー、ジョブ流れたー、オートスケールして queue待ち無し、サイコー︕ •

    オンプレ = A Cluster For All • クラウド = A Cluster For You • クラスターの数増えると地獄 Admin Users pcluster xxx AWS Cloud ParallelCluster AutoScaling Spot/Ondemand Compute Nodes Master Node Management Node ssh/vnc ssh manual setup
  6. With Pipeline • ⼿作業は全部post_instalスクリプト化 • クラスターConfigもpost_instalスクリプトもGit に突っ込む、Jenkinsでファイル配置 • クラスターの起動から設定まで⾃動化 •

    最重要指標=(計算スループット) / (コスト) • パフォーマンスとコスト最適化ループを⾼速で回す • 全部Gitに⼊ってるから、変更管理もバッチリ Admin Users hook push push scripts push configs pcluster xxx run post install scripts Amazon CloudWatch put metrics AWS Cloud ParallelCluster AutoScaling Spot/Ondemand Compute Nodes Master Node S3 Bucket Management Node Git Jenkins ssh/vnc
  7. ParallelCluster v2.9.0 • 2020/09/12 Releaed • ENHANCEMENTS • 複数コンピュートインスタンスタイプのサポート(Slurmスケジューラーのみ対応) •

    ARMインスタンスでのNICE DCVサポート • .metalインスタンスでのDisabling Hyperthreadingのサポート • https://github.com/aws/aws-parallelcluster/releases/tag/v2.9.0 • 4年越しの願いがかなったー
  8. re:Invent 2019 • 同じ話をre:Invent2019のParallelClusterワークショップでしてきました。 • CMP402 Setting up and optimizing

    your HPC cluster on AWS • 自前のハンズオン https://qiita.com/porcaro33/items/0d3d7458322af60e400f
  9. 富岳 – ARM – Graviton2 • スーパーコンピュータ「富岳」TOP500、HPCG、HPL-AI、 Graph500において世界第1位を獲得 https://www.riken.jp/pr/news/2020/20200623_1/ •

    富岳のCPUはARMベースの専⽤チップ • AWSでARMといえばGraviton • Graviton2はハミルトン先⽣も激推し • Graviton2で40%コスパよくなるかも https://www.youtube.com/watch?v=gyWcg0FLdLw • ベンチマーク楽しみ