Jupyter Notebook (jupyterhub)で ruby とグラフ / k-ruby 20th

2018/04/11 の第20回 k-ruby の資料です。

Transcript

1. Jupyter Notebook (jupyterhub)で rubyとグラフ 鹿児島大学学術情報基盤センター 下園幸一 simozono@cc.kagoshima-u.ac.jp 2018/04/11 第20回 K-Ruby 1
2. Jupyter Notebook 概説(1)  ジュパイターでもジュピターでもいいみたい ◦ http://youglish.com/search/Jupyter  経緯 ◦ 元々は IPython Notebook ◦ その後、Python だけでなく、Julia , Rにも対応 Julia + Python + R = Jupyter ◦ 現在は、Ruby, Haskell, Scala, node.js 等にも対応 ◦ 7つの言語の Juputer Notebook を作る  https://matsubara0507.github.io/posts/2017-04-24-create- jupyter-for-seven-lang-part1.html  Project Jupyter が開発元 ( http://jupyter.org ) 2018/04/11 第20回 K-Ruby 2
3. Jupyter Notebook概説(2)何ができるの？  一言で言うと「Web上でのPython等言語の対 話的実行環境」 ◦ http://techlife.cookpad.com/entry/write-once- share-anywhare ◦ コードと実行結果と説明文(Markdown)を同時に扱 う ◦ コードとグラフを同一画面で扱う ◦ コードの改変、再実行可能 ◦ 全てWeb(ブラウザ)上で ◦ github 等を用いて notebook を共有  データサイエンス界隈で利用者多数 ◦ python + pandas + scipy + matplotlob ◦ 語の分散表現(word2vec)関連では + gensim 2018/04/11 第20回 K-Ruby 3
4. Jupyter Notebook概説(3)デモ  非公開 ◦ github(gist)に notebookの本体( .ipynb)を push すると、きれいに表示してくれる ◦ GitLab(CE)でも、それなりに表示してくれる  私が構築した GitLab(CE)では、グラフが表示されない ◦ nbviewer というのを利用すると github 等を利 用しなくてもきれいに表示してくれるらしいが 使ったことない 2018/04/11 第20回 K-Ruby 4
5. Jupyter Notebook Architecture  http://jupyter.readthedocs.io/en/latest/architecture/how_jupyter_ipyth on_work.html より 2018/04/11 第20回 K-Ruby 5
6. Jupyter Notebook概説(5) 導入  Anaconda で、python を含め全て入る ◦ Windows/Mac/Linux ◦ データ分析に必要な python パッケージも入る ◦ パッケージ管理もできる ◦ https://www.anaconda.com/download/  Anaconda を利用しなくても導入はできる が For new users, we highly recommend installing Anaconda. (Jupyter Documentation より) 2018/04/11 第20回 K-Ruby 6
7. Jupyter Notebook概説(6) 今後  Jupyter Notebook から JupyterLab に進化 ◦ 2014年に Jupyter Notebook になる ◦ 2016年から次世代版 Jupyter Notebook として JupyterLab プレ ビュー公開 ◦ 2018/02 ベータ版公開 ◦ 正式版は2018年内か？  操作性向上  csv, json がきれいに表示されるらしい https://news.mynavi.jp/article/20180221-587178/ 2018/04/11 第20回 K-Ruby 7
8. Jupyterhub Jupyterlab-hub について  Jupyter Notebook や JupyterLab は、一人で使用することを想定 ◦ サーバに導入して、複数で利用したい(教育環境等)  Jupyterhub Jupyterlab-hub はユーザ認証機能を付けたもの ◦ サーバのローカルユーザ作成されていれば導入はそこそこ難しくない ◦ LDAP等の場合は… 試していないのでわからない 2018/04/11 第20回 K-Ruby 8
9. Jupyter Notebook で ruby  基本的には iruby という Jupyter Notebook 用 ruby kernel を導入すればよい ◦ http://devopspy.com/linux/ruby-kernel-jupyter- notebook/ ◦ https://qiita.com/kozo2/items/8e0cf0d1f5672ac 2f745  「The Ruby kernel requires ZeroMQ, hence it’s C and Ruby bindings」で、OS標準のパッ ケージとバージョンがあわないとかでさんざん 苦労したような気がするが…忘れた  デモ 2018/04/11 第20回 K-Ruby 9
10. jupyter notebook の ruby でグラフ(1)  数種類の方法がある ◦ nyaplot  動かなかった。ここ数年メンテナンスされていない ◦ rbplotly  動く ◦ gnuplot  動く ◦ daru + numo-gnuplot  動く ◦ daru + daru-plotly  動く  daru とは ◦ ruby で DataFrame を扱うもの  Python の pandas みたいなもの 2018/04/11 第20回 K-Ruby 10
11. jupyter notebook の ruby でグラフ(2)  rbploty ◦ plotly を ruby で使うために必要 ◦ plotly  データ可視化プラットフォーム (https://plot.ly/) ◦ plotly の作図方法  APIを叩くもの (plotlyのサーバと通信)  頻繁な場合は有料  plotly.js を利用する  plotly.js はオープンソース化されていて無料 ◦ rbploty がどちらを使っているかは知らない  どちらにも対応しているみたいだが。 2018/04/11 第20回 K-Ruby 11
12. jupyter notebook の ruby でグラフ(3) 2018/04/11 第20回 K-Ruby 12 require 'rbplotly' trace1 = { x: ['a',2,3,4,5,6], y: [100,200,300,400,500,600] } trace2 = { x: ['a',2,3,4,5,6], y: [600,500,400,300,200,100] } traces = [trace1, trace2] pl = Plotly::Plot.new(data: traces) pl.show  これくらいのコードで、以下のグラフが描ける
13. jupyter notebook の ruby でグラフ(2)  daru + daru-plotly を業務で使用 ◦ 「eduroam利用回数」  ログから eduroam(無線LAN)のアクセス解析  面倒だった点 ◦ 2つの値と1つの値で値域が大きく異なる  2軸のグラフにしたい ◦ これを実装したいためplotly のドキュメントをよ みまくる  https://plot.ly/python/ あたりの Python 用APIドキュ メントを見ながら Python での dict を ruby の Hash だと考えていろいろやった。 2018/04/11 第20回 K-Ruby 13