Reticulate_and_RStudio.pdf

Transcript

1. RETICULATEパッケージと RSTUDIO TokyoR#73 t_usausausa
2. 自己紹介 ▪ twitter : t_usausausa ▪ お仕事 : 受託会社のDS -> 事業会社のDS(Pairsの中の人) ▪ 言語 : SQL, R, Python ▪ 最近のメイン業務 : データ分析基盤設計､開発
3. お詫び ▪ Pairsの分析的な内容ではありません – それは別の機会に ▪ 当初はreticulateからpytorchを呼び出す的な内容でしたが､それよりもRStudioに ついて発表すべきと思い切り替えました – 実際呼び出して予測するところまでは確認済みです
4. 検証環境 ▪ Windows10 (Windows subsystem for Linux) ▪ R 3.5.1 ▪ RStudio 1.2 Previrew版 ▪ reticulate 1.10
5. RStudio 1.2の特徴の1つ ▪ R以外の言語のサポート – Python – C/C++ – SQL – Stan
6. reticulate is 何 ▪ RStudio社の作ったRからPythonを呼び出すパッケージ – 「reticulated python」でアミメニシキヘビらしい ▪ これまでにもRからPythonを呼び出すライブラリはあったが､モダンな開発環境 に合わせて使いやすくなっている
7. reticulateとPythonInRの違い reticulate PythonInR リリース時期 2017/03/14 2015/07/09 仮想環境 利用可能 利用不可能(デフォルトパス のPython利用) 記述方法 後述 関数のパラメータにPython コード埋め込み R <-> Python間でのデータ受 け渡し 受け渡し用クラス(R : pyクラ ス, Python : rクラス) 関数実行の戻り値 CRAN https://cran.r- project.org/web/packages/reti culate/index.html https://cran.r- project.org/web/packages/Pyt honInR/index.html
8. reticulateの使い方 ▪ reticulateはinstallするだけでお手軽に使え る ▪ 更に仮想環境を指定することもできる – use_python() : 利用するpythonのパス を指定 – use_virtualenv() : 利用するvirtualenv で作った仮想環境を指定 – use_condaenv() :利用するanacondaで 作った仮想環境を指定 install.packages("reticulate") library(reticulate) # anacondaで作った仮想環境を参照する use_condaenv("reticulate", required = TRUE) # 環境の確認 py_config()
9. 4種類の記述方法 1. PythonモジュールをRのクラスにする ▪ 任意のPythonモジュールをRのクラスとして扱うことが可能 – 特定の関数を使いたいときに便利 – クラス内において「.」でメソッドチェーンを行う処理には向かない
10. 4種類の記述方法 2. Pythonスクリプト呼び出し ▪ Pythonのソースコードを読み込んで､実行､またはそこに定義されている関数をR の関数として読み込むことができる – すでにPythonのモジュールがあり､それをRで利用したい人向け
11. 4種類の記述方法 3. インタラクティブ起動 ▪ repl_python()と実行するとRのコン ソールからPythonのコンソールへと 切り替わる – Pythonコードをそのまま実行可 能 – 現状､RStudio側に問題があるた め結構使いにくいところがある
12. 4種類の記述方法 4. R Markdownの記述を実行する ▪ R notebookのチャンクにpythonを指定して記述 & 実行 – Pythonコードをそのまま実行可能 – 現状､RStudio側に問題があるため大変使いにくいところがある
13. これだけ見てるともうPython書くの もRStudioでいいじゃんって気になり ませんか…?
14. reticulateとRStudioの連携で駄目な点 1. Pythonスクリプトをコンソールに送れ ない ▪ インタラクティブモード起動時､pyファイルに書かれているコードをコンソール に送って実行してもらえない – 逆にRファイルに書いてあるPythonコードは送れる – RStudioの仕様で､コンソールに送れるコードはR関連のファイルに記述され ているものだけに限られるから…?
15. reticulateとRStudioの連携で駄目な点 2. チャンクを変えるとPythonのセッショ ンがリセットされる ▪ R Markdown形式での記述の場合､Rで はチャンクを変えても変数が保存さ れるが､Pythonはなぜか保存されない – importなどもリセットされるの でセッションが異なる模様 – 1つのチャンク内で完結するよう にコードを書けばよいが､それは ナンセンス
16. reticulateとRStudioの連携で駄目な点 3. チャンク間での変数受け渡し不可能 ▪ reticulateはpythonならばrクラス､Rならばpyクラスを通じて変数の受け渡しが可 能となっているが､チャンクを利用した記述ではこれらの変数は利用できない – 前述のセッションリセットにも絡む問題…?
17. というわけでまだRStudioをPythonの エディタとして利用するのは早計な のでは???
18. 逆にこれらの問題が解決すれば RStudioは素晴らしいエディタになる はず…!!!
19. enjoy !!!