Upgrade to Pro
— share decks privately, control downloads, hide ads and more …
Speaker Deck
Features
Speaker Deck
PRO
Sign in
Sign up for free
Search
Search
qeMLパッケージの紹介
Search
bob3bob3
December 15, 2023
Science
0
1.7k
qeMLパッケージの紹介
caretやtidymodelsと同じような機械学習のラッパーqeMLパッケージの紹介
bob3bob3
December 15, 2023
Tweet
Share
More Decks by bob3bob3
See All by bob3bob3
RでPSM分析
bob3bob3
1
200
Rでコンジョイント分析 2024年版
bob3bob3
0
890
『改訂新版前処理大全』の話と Apache Parquet の話 #TokyoR
bob3bob3
0
740
R言語の環境構築と基礎 Tokyo.R 112
bob3bob3
0
480
『データ可視化学入門』をPythonからRに翻訳した話(増強版)
bob3bob3
0
430
『データ可視化学入門』を PythonからRに翻訳した話
bob3bob3
1
510
「国と音楽」 ~spotifyrを用いて~ #muana
bob3bob3
2
500
パーマーステーションのペンギンたち#3 探索的データ分析(EDA)編
bob3bob3
1
620
Redditで遊ぼう #TokyoR 106
bob3bob3
0
670
Other Decks in Science
See All in Science
私たちのプロダクトにとってのよいテスト/good test for our products
camel_404
0
200
ベイズのはなし
techmathproject
0
340
Machine Learning for Materials (Lecture 9)
aronwalsh
0
230
証明支援系LEANに入門しよう
unaoya
0
460
化学におけるAI・シミュレーション活用のトレンドと 汎用原子レベルシミュレーター: Matlantisを使った素材開発
matlantis
0
300
Snowflakeによる統合バイオインフォマティクス
ktatsuya
PRO
0
520
マテリアルズ・インフォマティクスの先端で起きていること / What's Happening at the Cutting Edge of Materials Informatics
snhryt
1
150
ベイズ最適化をゼロから
brainpadpr
2
900
ultraArmをモニター提供してもらった話
miura55
0
200
マクロ経済学の視点で、財政健全化は必要か
ryo18cm
1
100
機械学習を支える連続最適化
nearme_tech
PRO
1
170
Visual Analytics for R&D Intelligence @Funding the Commons & DeSci Tokyo 2024
hayataka88
0
110
Featured
See All Featured
Fireside Chat
paigeccino
34
3.1k
Learning to Love Humans: Emotional Interface Design
aarron
273
40k
Site-Speed That Sticks
csswizardry
2
190
Automating Front-end Workflow
addyosmani
1366
200k
Producing Creativity
orderedlist
PRO
341
39k
Distributed Sagas: A Protocol for Coordinating Microservices
caitiem20
330
21k
We Have a Design System, Now What?
morganepeng
51
7.3k
VelocityConf: Rendering Performance Case Studies
addyosmani
326
24k
Java REST API Framework Comparison - PWX 2021
mraible
PRO
28
8.3k
What's in a price? How to price your products and services
michaelherold
243
12k
I Don’t Have Time: Getting Over the Fear to Launch Your Podcast
jcasabona
29
2k
Sharpening the Axe: The Primacy of Toolmaking
bcantrill
38
1.9k
Transcript
qeMLパッケージの紹介 R研究集会2023 (2023/12/16) @bob3bob3
qeMLパッケージとは? • caret、mlr3、tidymodelsと同じような、機械 学習に統一的なインターフェイスを提供する ラッパー。 • 「qe」は「quick and easy」。 •
とにかくシンプルで「 one liner」で機械学習を 事項できるのが売り。
作者 Norman Matloff The Art of R Programming (2011) の著者。
実行例 library(qeML) # メジャーリーガーのデータセット。ポジション、身長、体重、年齢 data(mlb1) # 体重を推定するモデル # 決定木、ランダムフォレスト、勾配ブースティング mlb1_rpart
<- mlb1 |> qeRpart("Weight") mlb1_rf <- mlb1 |> qeRFranger("Weight") mlb1_gb <- mlb1 |> qeGBoost("Weight")
実行例 # 推定 new_data <- data.frame(Position='Catcher', Height=73, Age=28) mlb1_rpart |>
predict(new_data) mlb1_rf |> predict(new_data) mlb1_gb |> predict(new_data) # これだけ! # 簡単だね!
Enjoy?
いやいや、まてまて • バリデーションは? • ハイパーパラメーターのチューニングは?
バリデーションは勝手にやってくれる # testデータでのMAE mlb1_rpart$testAcc mlb1_rf$testAcc mlb1_gb$testAcc data.frame( name = c("rpart",
"rf", "gb"), MAE = list(mlb1_rpart, mlb1_rf, mlb1_gb) |> map_dbl(\(x) pluck(x, "testAcc")) ) |> arrange(MAE) # name MAE # 1 rf 13.23741 # 2 gb 13.74169 # 3 rpart 14.24358
チューニングもできる # ランダムフォレストのグリッドサーチ例 qs_ft_rf <- mlb1 |> qeFT( "Weight", "qeRFranger",
pars = list(nTree= seq(100, 1000, 250), minNodeSize= seq(10, 30, 10)), nTst = 100, nXval = 10, showProgress=TRUE ) qs_ft_rf$outdf |> slice_min(meanAcc) # nTree minNodeSize meanAcc CI bonfCI # 1 350 10 8.326976 8.531146 8.653432
その他の機能 • 次元縮約、次元削減 • 並列化 • 欠損補完 • モデルの比較 •
Quick Start, ML Overviewなど親切なビネットがたくさん! • データセットも山盛り
……ただし • まだまだ開発中で発展途上。 • ドキュメントも書きかけという感じ。 • 実装されている手法がcaret、tidymodelsと比べるとまだ少ない。 • 実装が不完全な手法もある(xgboost, lightgbmなど)
• バリデーションの評価指標を変更ができない • Macだとインストールできないらしい(誰か検証して!)
Enjoy!