CDSB ConectaR 2021

Transcript

1. Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática @CDSBMexico @RBioinformatica
2. ¿Quién sabe qué es ? Sandrine Dudoit Una de las fundadoras del proyecto @Bioconductor! @cendrinou https://www.stat.berkeley.edu/users/sandrine/ @lcgunam Otoño 2007 Slides: speakerdeck.com @CDSBMexico Todo comenzó con una pregunta
3. http://www.wholebiome.com/team.html#james-bullard James Bullard Enero 2008 Curso intensivo de 1 semana
4. @AlexielMedyna Leonardo Collado Torres + Alejandra Medina Rivera BioC2008 Developer’s day + 2 conference days Gracias al apoyo de @lcgunam @lcolladotor
5. La meta es completar el Ciclo de Enseñanza • Alguien entrena a la comunidad local. • Los miembros locales toman la iniciativa de aprender más. • (Idealmente) Los miembros locales entrenan a otros miembros de la comunidad local. Slides: @CDSBMexico
6. @fellgernon & Osam http://lcolladotor.github.io/courses/Courses/R/ Otoño 2008 El ciclo parecía completarse, pero...
7. Algunos problemas con el ciclo de enseñanza: • Necesita voluntarios • Cuando los miembros locales se van es difícil continuar el ciclo. • Encontrar financiamiento puede representar un reto. • Barreras de lenguaje
8. Datos de los 667 paquetes sometidos a Bioconductor mediante Github en 2018 Alejandro Reyes @areyesq http://alejandroreyes.org/ BioC2017
9. http://congresos.nnb.unam.mx/
10. → Usuarios →Desarrolladores ¿Cómo podemos facilitar este paso en LA/México? Personas con interés
11. No estamos solos: • Consejos, ideas, • Material de enseñanza, • Actividades para construir comunidad, • Instructores voluntarios, • Financiamiento, • Visibilidad
12. Nuestra red local Experience organizing workshops, local payment infrastructure, legal body & bank accounts, classroom infrastructure for bioinformatics, official letters, reservations & support for guests, teaching assistants, direct access to identify local needs, ... @nnb_unam @RBioinformatica @ccg_unam @lcgunam
13. Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática (CDSB) ¿Cómo eliminamos las barreras?
14. Talleres anuales de desarrollo de software
15. https://www.youtube.com/channel/UCHCdYfAXVzJIUkMoMSGiZMw ¡Sé parte de nuestros talleres!
16. Alentamos y apoyamos a nuestros miembros en sus aplicaciones para becas y oportunidades
17. @doctor_calvo @josschavezf1
18. @AnaBetty2304 Co-fundadora de @RLadies_Qro
19. Creamos Redes de trabajo • Aprendiendo de otros • Conociendo potenciales instructores • Pidiendo ayuda • Asegurando que los nuevos integrantes se sientan incluídos • ...
20. @josschavezf1
21. https://comunidadbioinfo.github.io/es/post/cdsb2020-building-workflows-with-rstudio-and-scrnaseq-with-bioconductor/#.YBAGMS1h1mA Tomando como base el workshop de rstudio::conf(2020) + Material de el libro OSCA Patrocinadores: Promover un ciclo de educación
22. Asesoramiento y desarrollo de proyectos de software libre El proyecto regutools
23. ¿Qué es regutools?
24. Definiendo un objeto S4 regulondb Integración con el ecosistema de Bioconductor Usando funciones como convert_to_granges()
25. Integración con otros paquetes de Bioconductor Integración con Gviz
26. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa575
27. Help us increase our visibility! Thx ^^ bit.ly/bioc2020cdsb Promovemos el trabajo de nuestros miembros
28. Intercambio de ideas y colaboraciones por medio de slack (simulando un departamento universitario)
29. Impulsamos a quienes desean tomar el liderazgo y formar sus propias comunidades Conoce a la comunidad de R-Ladies México https://rladiesmx.netlify.app
30. Comité de CDSB hasta 2019 Incluir a nuevos miembros es indispensable
31. Para evitar repetir el pasado invita a nuevos voluntarios! @josschavezf1 @erickchufe
34. 2019 https://github.com/ComunidadBioInfo/mxearthquakes https://github.com/ComunidadBioInfo/praiseMX
35. 2020 Empiezo a hacer 2 paqueterías relacionadas con mi proyecto https://www.cancer.org/es/noticias-recientes/preguntas-comunes-acerca-del-brote-del-nuevo-corona virus.html https://github.com/Erickcufe
36. 2020 3 miembros más de mi laboratorio asistieron https://github.com/Erickcufe/starwarssay
37. IMPACTO - Aceleración de adquisición de conocimiento - Asesoría - Inspiración - Conocer más comunidades de R - Eventos y becas - Networking - Responsabilidad y experiencia - Comunidad - Acceso a contenido en español Problemática en México y Latinoamérica...
38. Proyectos a futuro TIBs 2021: 2 workshops -Best practices for bioinformatics workflows using R, RStudio, Git, and GitHub -Advanced analysis of single-cell RNA-seq data with R. From documentation to results. Diciembre 2020 - Junio 2021 https://youtu.be/rtyv49poP_k
39. Envíanos un correo electrónico a: cdsbmexico@gmail.com ¿Cómo puedes ser parte de esta comunidad? @CDSBMexico @CDSBMexico https://comunidadbioinfo.github.io/
40. https://www.youtube.com/channel/UCHCdYfAXVzJIUkMoMSGiZMw ¡Sé parte de nuestros talleres!
41. ¡Gracias!