Upgrade to Pro
— share decks privately, control downloads, hide ads and more …
Speaker Deck
Features
Speaker Deck
PRO
Sign in
Sign up for free
Search
Search
コンペティションから見るAI創薬/AI drug discovery in the view ...
Search
m_mochizuki
March 18, 2019
Research
2
1.6k
コンペティションから見るAI創薬/AI drug discovery in the view of competitions
日本オミックス医学会シンポジウム 発表資料
場所: 東京医科歯科大学
日付: 2019/3/18
2018/3/20 誤記修正
2018/3/21 誤記修正
m_mochizuki
March 18, 2019
Tweet
Share
More Decks by m_mochizuki
See All by m_mochizuki
SIGNATE: 日本取引所グループ ファンダメンタルズ分析チャレンジ 1位解法 / the 1st place solution of JPX Fundamentals Analysis Challenge on SIGNATE
m_mochizuki
4
13k
SIGNATE: 日本取引所グループ ファンダメンタルズ分析チャレンジ 暫定1位解法 / the provisional 1st place solution of JPX Fundamentals Analysis Challenge on SIGNATE
m_mochizuki
3
9.6k
MD-DSC研究会講演資料:『機械学習コンペティションの実際とその意義』/ Practice on ML competition and its significance
m_mochizuki
1
1.2k
Other Decks in Research
See All in Research
Stealing LUKS Keys via TPM and UUID Spoofing in 10 Minutes - BSides 2025
anykeyshik
0
180
AIスパコン「さくらONE」のLLM学習ベンチマークによる性能評価 / SAKURAONE LLM Training Benchmarking
yuukit
2
970
さまざまなAgent FrameworkとAIエージェントの評価
ymd65536
1
410
一般道の交通量減少と速度低下についての全国分析と熊本市におけるケーススタディ(20251122 土木計画学研究発表会)
trafficbrain
0
150
スキマバイトサービスにおける現場起点でのデザインアプローチ
yoshioshingyouji
0
280
Can AI Generated Ambrotype Chain the Aura of Alternative Process? In SIGGRAPH Asia 2024 Art Papers
toremolo72
0
130
データサイエンティストをめぐる環境の違い2025年版〈一般ビジネスパーソン調査の国際比較〉
datascientistsociety
PRO
0
660
"主観で終わらせない"定性データ活用 ― プロダクトディスカバリーを加速させるインサイトマネジメント / Utilizing qualitative data that "doesn't end with subjectivity" - Insight management that accelerates product discovery
kaminashi
15
20k
【NICOGRAPH2025】Photographic Conviviality: ボディペイント・ワークショップによる 同時的かつ共生的な写真体験
toremolo72
0
150
SREのためのテレメトリー技術の探究 / Telemetry for SRE
yuukit
13
2.9k
ペットのかわいい瞬間を撮影する オートシャッターAIアプリへの スマートラベリングの適用
mssmkmr
0
220
OWASP KansaiDAY 2025.09_文系OSINTハンズオン
owaspkansai
0
110
Featured
See All Featured
The Success of Rails: Ensuring Growth for the Next 100 Years
eileencodes
47
7.9k
Thoughts on Productivity
jonyablonski
74
5k
The State of eCommerce SEO: How to Win in Today's Products SERPs - #SEOweek
aleyda
2
9.5k
Dominate Local Search Results - an insider guide to GBP, reviews, and Local SEO
greggifford
PRO
0
67
Building Applications with DynamoDB
mza
96
6.9k
Designing Experiences People Love
moore
144
24k
Become a Pro
speakerdeck
PRO
31
5.8k
Odyssey Design
rkendrick25
PRO
1
490
B2B Lead Gen: Tactics, Traps & Triumph
marketingsoph
0
52
The SEO identity crisis: Don't let AI make you average
varn
0
62
The Illustrated Guide to Node.js - THAT Conference 2024
reverentgeek
0
250
Digital Ethics as a Driver of Design Innovation
axbom
PRO
1
170
Transcript
a I ( M A M89 :) 3 /21 1
/ 0/ ) ) A c
s ( 21 1- 40 z ( u 76 6
7 ) ) h o 7M M AI( : 7 r a ( k c 7 i
3 IS o J P 123 32 0 J P
T 0 J P T 0 J P T 6 n 0 J P T 4 DJ PG C A 7E5 D4J A C C eB E5
P GI gGI M ci 06?5:
0 65A 4? 5 B C 84 6 76 .?4 8 11ae h M ci 2 3 gM N M ci g T M
6 AI= +.9<*!%;7BG =?4D +.1:/"(&#*
5C0 A, "(&$ = %&' )6F5C=? >@8E3 -23
<; .%7 FC*
'4 <;p53L. + '&(AE!1IBM) DK5=(FC*'40 BH1G .%7D/:36I (-"8$) .%7>@1G JD ↑ # 2?, )9
1
1 0 0 n RAK ) S2 AK K n
g 1 0 Ra Ra 0 5 Q e ( 425 %10/7& (! * , 10/(! $%)+.# # " 425 'Kaggle(063(-
1 n eh a kGn f R / :/ V
Fod eh aFH lm g Sb RHMS A n V . :/ i eh a cS A p 2 / /: / ./: :.
M ,1 42 , 2 , 0 0 9 22
3. n ? n : AC
None
4 1 #)$ ' !%( * $
(Convolutional Neural Network) $ %" & &
1 $)& (" Fingerprint/Descriptor % & (Graph
Convolutional Neural Network) & ! # ' '
n 1 G 6 C n N : Altae-Tran et
al, ACS Cent. Sci.,2017,3(4), pp 283–293
n ( ) P O N B A n I
24 0 2 1 1 Virtual screening… 1 2 3
n N G n K C 967 ( #
&).0 *! "%*@ =1;=>* *(400) 4?:<A5).0 “”* */$, 862?3' +(-OK
7 8 T d fng ] N mi a M
hmi ] C [ Ct ep r a 21 . ? 0 ?9 5 ( ) ) ( )( 02 s y , 9 T u CG ] NaY I
( 7 2 Extended Connectivity Fingerprint Functional Connectivity Fingerprint Topological
Torsions Atom Pairs Fingerprint RDKit Fingerprint Avalon fingerprint !fingerprint (6) 70 Random Forest Extremely Randomized Trees Gradient Boosted Trees Multilayer perceptron Support Vector Regression ! $)%(&' (5) 65 = 30# Elastic Net Pfinal Level 0 Level 1 " # 1 2 ) ):
Fingerprint ECFP FCFP TT AP RDK AVLN F-Stacking RF
0.848 0.855 0.816 0.686 0.652 0.722 0.892 ERT 0.869 0.889 0.844 0.798 0.671 0.768 0.907 GBT 0.852 0.864 0.835 0.808 0.733 0.758 0.891 MLP 0.802 0.777 0.623 0.814 0.651 0.712 0.895 SVR 0.856 0.852 0.688 0.763 0.662 0.693 0.877 L-Stacking 0.890 0.911 0.870 0.881 0.799 0.846 0.930 FL-Stacking Level0 ROC-AUC ) 1 ) (0( 72 n 0 3 0 0
2 ( 7 )1)0 3 5
IMSBIO () ( ) 1 8 1 Univ-shizuoka 1 PFDrug ()Preferred Networks 1 kiharalab 1 1 Graph CNN
1 0
38 5 120 n 0 u ”Taklbe : () :.
00 1Tcn n s T n p w Th cn dg I I “ L ing n r P v T ng D n T t p o y 2 8: : .2 1 2 - // /: 0:
)0 3 6 ( 2 1 n Lel an f
LN b i - b i -/) - n U N gc d - s n D - b i ( 1) -1- P t ( 1) ) vo el an (
)0 37 ( 2 1 n 24 9: 9 0
4 n 1 9 9 56 8 2 3 W 2 9 4 O O O !!!
9 21 n e l ( g n K n
) a )
20 2 3 n 3 t 1 o r ru
2 a i 1 o ru ) 2 l1 ru 1es 2 1 r f K2 n (( h g g K2
1 3 n ( ) ) n : )
X 8 T 9 8. A T 9 8. A
T 9 8. A 0 3 T . 9? A 5 2
( • 9) : / 51) 5 • 1 55
5 2 1:023/ 5