Upgrade to Pro
— share decks privately, control downloads, hide ads and more …
Speaker Deck
Features
Speaker Deck
PRO
Sign in
Sign up for free
Search
Search
MD-DSC研究会講演資料:『機械学習コンペティションの実際とその意義』/ Practice ...
Search
m_mochizuki
January 22, 2019
Science
1
1.2k
MD-DSC研究会講演資料:『機械学習コンペティションの実際とその意義』/ Practice on ML competition and its significance
2019年1月22日 医療・創薬 データサイエンスコンソーシアム研究会 講演資料
m_mochizuki
January 22, 2019
Tweet
Share
More Decks by m_mochizuki
See All by m_mochizuki
SIGNATE: 日本取引所グループ ファンダメンタルズ分析チャレンジ 1位解法 / the 1st place solution of JPX Fundamentals Analysis Challenge on SIGNATE
m_mochizuki
4
13k
SIGNATE: 日本取引所グループ ファンダメンタルズ分析チャレンジ 暫定1位解法 / the provisional 1st place solution of JPX Fundamentals Analysis Challenge on SIGNATE
m_mochizuki
3
9.7k
コンペティションから見るAI創薬/AI drug discovery in the view of competitions
m_mochizuki
2
1.6k
Other Decks in Science
See All in Science
AkarengaLT vol.41
hashimoto_kei
1
120
データマイニング - ウェブとグラフ
trycycle
PRO
0
260
安心・効率的な医療現場の実現へ ~オンプレAI & ノーコードワークフローで進める業務改革~
siyoo
0
480
データベース09: 実体関連モデル上の一貫性制約
trycycle
PRO
0
1.1k
(メタ)科学コミュニケーターからみたAI for Scienceの同床異夢
rmaruy
0
180
高校生就活へのDA導入の提案
shunyanoda
1
6.3k
あなたに水耕栽培を愛していないとは言わせない
mutsumix
1
280
20260220 OpenIDファウンデーション・ジャパン ご紹介 / 20260220 OpenID Foundation Japan Intro
oidfj
0
150
MCMCのR-hatは分散分析である
moricup
0
610
力学系から見た現代的な機械学習
hanbao
3
4k
NDCG is NOT All I Need
statditto
2
2.9k
Celebrate UTIG: Staff and Student Awards 2025
utig
0
1.2k
Featured
See All Featured
Beyond borders and beyond the search box: How to win the global "messy middle" with AI-driven SEO
davidcarrasco
3
68
The Director’s Chair: Orchestrating AI for Truly Effective Learning
tmiket
1
130
Fireside Chat
paigeccino
42
3.8k
Navigating Weather and Climate Data
rabernat
0
130
Fashionably flexible responsive web design (full day workshop)
malarkey
408
66k
Fight the Zombie Pattern Library - RWD Summit 2016
marcelosomers
234
17k
The Curse of the Amulet
leimatthew05
1
9.8k
Facilitating Awesome Meetings
lara
57
6.8k
A better future with KSS
kneath
240
18k
Site-Speed That Sticks
csswizardry
13
1.1k
Lessons Learnt from Crawling 1000+ Websites
charlesmeaden
PRO
1
1.1k
The Cult of Friendly URLs
andyhume
79
6.8k
Transcript
-) M S C AI : a 01 /01 21
( c 9 ( A C D 9 9
h a ( 21 1- 40 o( c A 76:
6:7 ) ) M 7 r ( z ( k I i u 7 s
0 S 234 43
1 S e 1 S e 1 S e 7 T 1 S e An J 6 DS GECJ 5A J AI o BE C P DS
n 4 n n
). 4 421 34 ( 42 42 5 42 !#"
$ #
"53 4(")) 6 -2*:1#'$&/, (96.+ !%7 804
7 n G l e n 11 y G n
s rt ce H S 7f R e o S n 7 l g 2 1 R7 g p S l n A f S 1 0 10R d 7 n Q i S G
n A DK
n A B I 4 n 4 O ( )
ONP4 Virtual screening … +(&,' ! !1 !2 !3 $ +(&,' " %!* # ) screening * # virtual screening
n K 967 ( # &).0 *! "%*@
=1;=>* *(400) 4?:<A5).0 “”* */$, 862?3' +(-OK
I T n 0,.. BD C7B99 icf [ L ?
1 20 N R ( ? F ,. 7 )7 0: : 0 . 0 R ( ] YSe y [ af ] ] : 9B B D ultm h s ui gi frns ui I ] ] [ vp [d [ Mg I 1 DC ? 2 C 8 ( ) ) ( 5
( 7 2 Extended Connectivity Fingerprint Functional Connectivity Fingerprint Topological
Torsions Atom Pairs Fingerprint RDKit Fingerprint Avalon fingerprint !fingerprint (6) 70 Random Forest Extremely Randomized Trees Gradient Boosted Trees Multilayer perceptron Support Vector Regression ! $)%(&' (5) 65 = 30# Elastic Net Pfinal Level 0 Level 1 " # 1 2 ) ):
Fingerprint ECFP FCFP TT AP RDK AVLN F-Stacking RF
0.848 0.855 0.816 0.686 0.652 0.722 0.892 ERT 0.869 0.889 0.844 0.798 0.671 0.768 0.907 GBT 0.852 0.864 0.835 0.808 0.733 0.758 0.891 MLP 0.802 0.777 0.623 0.814 0.651 0.712 0.895 SVR 0.856 0.852 0.688 0.763 0.662 0.693 0.877 L-Stacking 0.890 0.911 0.870 0.881 0.799 0.846 0.930 FL-Stacking Level0 ROC-AUC (3 )1)072 n 0 3 0 0
1 n o y mls))(,D ipF e n )- JA
H DN TB a e a n AB a e R )-0 1 18 2 6 1 - 6 1 0 1 r tqR ni +*, )('! #% )('! " $& +*,
1 5 n C ( 2 N3 8B? T DG
1 ) ) )1 1 ) ) ) ) 1 1 ) ) ) ) )1 1 1 1 1 1 1 6 A B 0 T DG 1 ) ) ) ) ) 1 1 ) ) ) 1 1 ) ) ) ) ) )1 1 1 1 1 1 1 0 J J :
)1 ( 6 1 3 n WR N TF.::A, c
n TF 22 a .2 32 iJ M eb gd h , A .: 1 5: B D8 , 0 /B: 2 CDB: C:8 ) (
B (A N 7 /: 7 n 5,-* 3/ %'
0)!(%'23/"1470)6 .#$+# & ) D 7 /: 7 7 /: 7J 1
1 8 B F J D n 0. 1 1
F : D B A 1 0 0 0 0.00 0.00 C 0 1 0 0 1.00 0.00 T 0 0 0 1 0.99 0.00 T 0 0 0 1 0.99 0.00 … G 0 0 1 0 0.41 0.00 A 1 0 0 0 0.00 0.00 ()
1 ( : 2 DJ B ) 9 n t
i D c Ai D A A he N D ? ? rs Aam n t ul o u Ai ? n D ( ( ) A Aam
: B 2 n A- U O10 26 . 0
n 2 . 8 0 ( J D : ) : (0)2 : 4 C A R
9B 00.1 5 AB: D 6 O C D J
C D C D ia k S 98 32 -4 ) ( n C - D n cg 3 ia k n B e N d n
n - 2
i I a v L ( we IT s I . 0 228 8 c n ) ) uhn yp n c bD I n log P r c bD t I d k( : ( . 0 .8 / 11 . 1 2
21 n ( e n a K l n 3
) g )
4 2 n 3 t 1 o r ru 2
a i 1 o ru ) 2 l1 ru 1es 2 1 r f K2 n (( h g g K2
5 5 n 2 5 ( ) ) n :
)
1 2 6 1 3 .(2 n 0 n 0
3 ) 2 n 0 0 1 1 3 n n 0 1 2