Upgrade to Pro
— share decks privately, control downloads, hide ads and more …
Speaker Deck
Features
Speaker Deck
PRO
Sign in
Sign up for free
Search
Search
MD-DSC研究会講演資料:『機械学習コンペティションの実際とその意義』/ Practice ...
Search
m_mochizuki
January 22, 2019
Science
1
1.2k
MD-DSC研究会講演資料:『機械学習コンペティションの実際とその意義』/ Practice on ML competition and its significance
2019年1月22日 医療・創薬 データサイエンスコンソーシアム研究会 講演資料
m_mochizuki
January 22, 2019
Tweet
Share
More Decks by m_mochizuki
See All by m_mochizuki
SIGNATE: 日本取引所グループ ファンダメンタルズ分析チャレンジ 1位解法 / the 1st place solution of JPX Fundamentals Analysis Challenge on SIGNATE
m_mochizuki
4
13k
SIGNATE: 日本取引所グループ ファンダメンタルズ分析チャレンジ 暫定1位解法 / the provisional 1st place solution of JPX Fundamentals Analysis Challenge on SIGNATE
m_mochizuki
3
9.6k
コンペティションから見るAI創薬/AI drug discovery in the view of competitions
m_mochizuki
2
1.6k
Other Decks in Science
See All in Science
baseballrによるMLBデータの抽出と階層ベイズモデルによる打率の推定 / TokyoR118
dropout009
2
650
力学系から見た現代的な機械学習
hanbao
3
3.8k
My Little Monster
juzishuu
0
420
風の力で振れ幅が大きくなる振り子!? 〜タコマナローズ橋はなぜ落ちたのか〜
syotasasaki593876
1
190
20251212_LT忘年会_データサイエンス枠_新川.pdf
shinpsan
0
220
機械学習 - DBSCAN
trycycle
PRO
0
1.4k
俺たちは本当に分かり合えるのか? ~ PdMとスクラムチームの “ずれ” を科学する
bonotake
2
1.1k
DMMにおけるABテスト検証設計の工夫
xc6da
1
1.5k
機械学習 - K近傍法 & 機械学習のお作法
trycycle
PRO
0
1.3k
高校生就活へのDA導入の提案
shunyanoda
0
6.2k
Vibecoding for Product Managers
ibknadedeji
0
120
白金鉱業Vol.21【初学者向け発表枠】身近な例から学ぶ数理最適化の基礎 / Learning the Basics of Mathematical Optimization Through Everyday Examples
brainpadpr
1
530
Featured
See All Featured
Practical Tips for Bootstrapping Information Extraction Pipelines
honnibal
25
1.7k
XXLCSS - How to scale CSS and keep your sanity
sugarenia
249
1.3M
The Myth of the Modular Monolith - Day 2 Keynote - Rails World 2024
eileencodes
26
3.3k
"I'm Feeling Lucky" - Building Great Search Experiences for Today's Users (#IAC19)
danielanewman
231
22k
Testing 201, or: Great Expectations
jmmastey
46
7.9k
Gemini Prompt Engineering: Practical Techniques for Tangible AI Outcomes
mfonobong
2
250
Prompt Engineering for Job Search
mfonobong
0
140
Crafting Experiences
bethany
0
29
How to Create Impact in a Changing Tech Landscape [PerfNow 2023]
tammyeverts
55
3.2k
How to build a perfect <img>
jonoalderson
1
4.8k
Raft: Consensus for Rubyists
vanstee
141
7.3k
Refactoring Trust on Your Teams (GOTO; Chicago 2020)
rmw
35
3.3k
Transcript
-) M S C AI : a 01 /01 21
( c 9 ( A C D 9 9
h a ( 21 1- 40 o( c A 76:
6:7 ) ) M 7 r ( z ( k I i u 7 s
0 S 234 43
1 S e 1 S e 1 S e 7 T 1 S e An J 6 DS GECJ 5A J AI o BE C P DS
n 4 n n
). 4 421 34 ( 42 42 5 42 !#"
$ #
"53 4(")) 6 -2*:1#'$&/, (96.+ !%7 804
7 n G l e n 11 y G n
s rt ce H S 7f R e o S n 7 l g 2 1 R7 g p S l n A f S 1 0 10R d 7 n Q i S G
n A DK
n A B I 4 n 4 O ( )
ONP4 Virtual screening … +(&,' ! !1 !2 !3 $ +(&,' " %!* # ) screening * # virtual screening
n K 967 ( # &).0 *! "%*@
=1;=>* *(400) 4?:<A5).0 “”* */$, 862?3' +(-OK
I T n 0,.. BD C7B99 icf [ L ?
1 20 N R ( ? F ,. 7 )7 0: : 0 . 0 R ( ] YSe y [ af ] ] : 9B B D ultm h s ui gi frns ui I ] ] [ vp [d [ Mg I 1 DC ? 2 C 8 ( ) ) ( 5
( 7 2 Extended Connectivity Fingerprint Functional Connectivity Fingerprint Topological
Torsions Atom Pairs Fingerprint RDKit Fingerprint Avalon fingerprint !fingerprint (6) 70 Random Forest Extremely Randomized Trees Gradient Boosted Trees Multilayer perceptron Support Vector Regression ! $)%(&' (5) 65 = 30# Elastic Net Pfinal Level 0 Level 1 " # 1 2 ) ):
Fingerprint ECFP FCFP TT AP RDK AVLN F-Stacking RF
0.848 0.855 0.816 0.686 0.652 0.722 0.892 ERT 0.869 0.889 0.844 0.798 0.671 0.768 0.907 GBT 0.852 0.864 0.835 0.808 0.733 0.758 0.891 MLP 0.802 0.777 0.623 0.814 0.651 0.712 0.895 SVR 0.856 0.852 0.688 0.763 0.662 0.693 0.877 L-Stacking 0.890 0.911 0.870 0.881 0.799 0.846 0.930 FL-Stacking Level0 ROC-AUC (3 )1)072 n 0 3 0 0
1 n o y mls))(,D ipF e n )- JA
H DN TB a e a n AB a e R )-0 1 18 2 6 1 - 6 1 0 1 r tqR ni +*, )('! #% )('! " $& +*,
1 5 n C ( 2 N3 8B? T DG
1 ) ) )1 1 ) ) ) ) 1 1 ) ) ) ) )1 1 1 1 1 1 1 6 A B 0 T DG 1 ) ) ) ) ) 1 1 ) ) ) 1 1 ) ) ) ) ) )1 1 1 1 1 1 1 0 J J :
)1 ( 6 1 3 n WR N TF.::A, c
n TF 22 a .2 32 iJ M eb gd h , A .: 1 5: B D8 , 0 /B: 2 CDB: C:8 ) (
B (A N 7 /: 7 n 5,-* 3/ %'
0)!(%'23/"1470)6 .#$+# & ) D 7 /: 7 7 /: 7J 1
1 8 B F J D n 0. 1 1
F : D B A 1 0 0 0 0.00 0.00 C 0 1 0 0 1.00 0.00 T 0 0 0 1 0.99 0.00 T 0 0 0 1 0.99 0.00 … G 0 0 1 0 0.41 0.00 A 1 0 0 0 0.00 0.00 ()
1 ( : 2 DJ B ) 9 n t
i D c Ai D A A he N D ? ? rs Aam n t ul o u Ai ? n D ( ( ) A Aam
: B 2 n A- U O10 26 . 0
n 2 . 8 0 ( J D : ) : (0)2 : 4 C A R
9B 00.1 5 AB: D 6 O C D J
C D C D ia k S 98 32 -4 ) ( n C - D n cg 3 ia k n B e N d n
n - 2
i I a v L ( we IT s I . 0 228 8 c n ) ) uhn yp n c bD I n log P r c bD t I d k( : ( . 0 .8 / 11 . 1 2
21 n ( e n a K l n 3
) g )
4 2 n 3 t 1 o r ru 2
a i 1 o ru ) 2 l1 ru 1es 2 1 r f K2 n (( h g g K2
5 5 n 2 5 ( ) ) n :
)
1 2 6 1 3 .(2 n 0 n 0
3 ) 2 n 0 0 1 1 3 n n 0 1 2