GitHubで行うreproducible research (GitHub Kaigi, Tokyo, 2014)

2014年6月1日に開催されたGitHub KaigiでのLT発表資料

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要旨

いかなる分野の学術研究においても、その再現性や信憑性は重要です。そのため研究者のreproducible researchに対する関心が近年高まっています。

発表者はGitHubがソーシャルコーディングの概念にもとづく開放的な環境を提供するということから、研究者が求める研究の誠実さを証明するツールとして効果的であると考えています。そこでGitHubの特徴・機能を活用したreproducibleなデータ解析から学術論文の作成までの手順の提案します。

Transcript

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   GitHub Kaigi(@Shibuya), June 1, 2014
   github.com/uribo
   

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4. Reproducible Research (RR)
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5. ։ൃऀͱՊֶऀͰڞ௨͢Δ΋ͷ
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   c, A., and J. B. Procter. 2012. PLOS Computational Biology 8
   1. Don’t Reinvent the Wheel
   2. Code Well
   3. Be Your Own User
   4. Be Transparent
   5. Be Simple
   6. Don’t Be a Perfectionist
   7. Nurture and Grow Your Community
   8. Promote Your Project
   9. Find Sponsors
   10. Science Counts
   

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6. ݚڀͷྲྀΕ
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11. ࿦จࣥච:
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12. Pull Request, IssuesΛ࢖ͬͨࠪಡ
    

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14. ·ͱΊ
    ▶ Computational Science ͚ͩͰͳ͘ɺ͍͔ͳΔ
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    ▶ Data analysis ͱ Writing ʹ GitHub ͕׆༻Ͱ
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