Bioinformatics, 37, 2021, i34–i41 doi: 10.1093/bioinformatics/btab327 ISMB/ECCB 2021 Statistical approaches for differential expression analysis in metatranscriptomics Yancong Zhang, Kelsey N. Thompson , Curtis Huttenhower and Eric A. Franzosa
x ijk :遺伝子の発現量iのトランスクリプ種ごとの転写物ラjのトランスクリプ条件kにマッピング(計おける転写量, x ik =Σ j x ijk C: x ijk /(Σ i=1 Nx ik /N),T: x ijk /(Σ i=1 Nx ijk /N),Tax RNA : Σ i=1 Nx ijk (計測ごとに「種個体あたりの遺伝子数のトランスクリプ代用)で計測、 DNAと書かれているものかれているものトランスクリプは不能。x ijk をメタゲノム版解析をしておけば推で計測、検出した遺伝子の発現量 数で計測、置き換えたもの。き換えたもの。えたものトランスクリプ。pは不能。形質(計測ごとに「種実験条件)で計測、依存性