R aplicado a epidemiología

Breves ejemplos demostrativos de cómo aplicar R en estudios descriptivos y analíticos.

Transcript

1. R aplicado a la Epidemiología Andree Valle Campos, MSc(c) Grupo de Trabajo de Investigación Epidemiológica y Evaluación de Intervenciones Sanitarias
2. http://bit.ly/epicdc2019 Contenido 1. ¿Qué necesidades existen en manejo de datos? 2. Ejemplos: Epidemiología Descriptiva y Analítica 3. Reporte de resultados
3. http://bit.ly/epicdc2019 ¿Qué se necesita en Epidemiología con respecto a manejo de datos? • Acceso inmediato a procesar los datos • Accesible para el usuario final • Formato limpio y fácil de comunicar
4. http://bit.ly/epicdc2019 ¿Qué es lo que hace a R aplicable en Epidemiología? • Descriptivos rápidos en formato personalizado. • Manipular salidas de modelos • Generar reportes directos con el análisis
5. http://bit.ly/epicdc2019 ¿Cómo resuelve estos pasos? • Paquetes! Extenciones al software creadas por la comunidad dplyr EpiR cdcper
6. http://bit.ly/epicdc2019 Programación literaria = Legible para un humano (texto) + Legible para una máquina (código)
7. http://bit.ly/epicdc2019 Ejemplos
8. http://bit.ly/epicdc2019 Epidemiología Descriptiva • Caracterizar la distribución de eventos en la población, tiempo y espacio. • Medidas de frecuencia: – Número de eventos – Tasa de eventos
9. http://bit.ly/epicdc2019 Ejemplo 1: Brote de Ébola 2014 ¿Cuántos casos hay en el tiempo? ¿Cuál es la distribución espacial? ¿Cuáles son las características de los casos?
10. http://bit.ly/epicdc2019 Epidemiología Analítica • Identificar causas u otros factores que influencien la ocurrencia de eventos • Medidas de asociación: – Cohorte →Recluta expuestos → Razón de Riesgos – Caso-control →Recluta casos → Razón de Odds – ...
11. http://bit.ly/epicdc2019 Razón de Riesgos
12. http://bit.ly/epicdc2019 Razón de Odds
13. http://bit.ly/epicdc2019 Ejemplo 2: Encuesta Whickham 1972-1974 Seguimiento luego de 20 años ¿Fumar está asociado a mortalidad?
14. http://bit.ly/epicdc2019 Conclusiones • R facilita el análisis descriptivo y ejecución de estadística inferencial. • R permite comunicar resultados con eficiencia conservando estándares de reproducibilidad.
15. http://bit.ly/epicdc2019 Links para iniciar • Rstudio primers – https://rstudio.cloud/learn/primers • Rstudio cheatsheets – https://www.rstudio.com/resources/cheatsheets/
16. http://bit.ly/epicdc2019 Proyecto disponible: http://bit.ly/epicdc2019 Dowload ZIP → Doble click en .Rproj
17. http://bit.ly/epicdc2019
18. http://bit.ly/epicdc2019 ¿Cómo facilita la comunicación? Rmd: Formatos para verificar y conducir análisis alternativos o repetitivos.
19. http://bit.ly/epicdc2019 ¿Qué es R? • Software Libre para la limpieza, análisis y comunicación estadística.