Upgrade to PRO for Only $50/Year—Limited-Time Offer! 🔥
Speaker Deck
Features
Speaker Deck
PRO
Sign in
Sign up for free
Search
Search
人流データを用いた人流制限解除後のCOVID-19感染状況の推定
Search
Yoriyuki Yamagata
November 27, 2021
Science
0
170
人流データを用いた人流制限解除後のCOVID-19感染状況の推定
Yoriyuki Yamagata
November 27, 2021
Tweet
Share
More Decks by Yoriyuki Yamagata
See All by Yoriyuki Yamagata
Individual-based epidemiological model of COVID19 using location data
yoriyukiprf
0
120
On proving consistency of equational theories in bounded arithmetic
yoriyukiprf
0
190
On proving consistency of equational theories in bounded arithmetic
yoriyukiprf
0
140
個人レベルの位置情報を使ったCOVID19の感染モデル
yoriyukiprf
0
120
Falsification of Cyber-Physical Systems Using Deep Reinforcement Learning
yoriyukiprf
0
170
引用の記述説の擁護
yoriyukiprf
0
240
Consistency proof of fragments of equational systems with substitution in bounded arithmetic
yoriyukiprf
0
130
Concepts on AI Fairness
yoriyukiprf
0
170
Falsification of Cyber Physical System Using Deep Reinforcement Learning
yoriyukiprf
1
170
Other Decks in Science
See All in Science
知能とはなにかーヒトとAIのあいだー
tagtag
0
120
データマイニング - ノードの中心性
trycycle
PRO
0
310
深層学習を用いた根菜類の個数カウントによる収量推定法の開発
kentaitakura
0
210
AI(人工知能)の過去・現在・未来 —AIは人間を超えるのか—
tagtag
0
120
データベース01: データベースを使わない世界
trycycle
PRO
1
910
デジタルアーカイブの教育利用促進を目指したメタデータLOD基盤に関する研究 / Research on a Metadata LOD Platform for Promoting Educational Uses of Digital Archives
masao
0
120
Performance Evaluation and Ranking of Drivers in Multiple Motorsports Using Massey’s Method
konakalab
0
120
安心・効率的な医療現場の実現へ ~オンプレAI & ノーコードワークフローで進める業務改革~
siyoo
0
410
論文紹介 音源分離:SCNET SPARSE COMPRESSION NETWORK FOR MUSIC SOURCE SEPARATION
kenmatsu4
0
420
AIに仕事を奪われる 最初の医師たちへ
ikora128
0
1k
mOrganic™ Holdings, LLC.
hyperlocalnetwork
0
200
academist Prize 4期生 研究トーク延長戦!「美は世界を救う」っていうけど、どうやって?
jimpe_hitsuwari
0
450
Featured
See All Featured
Optimising Largest Contentful Paint
csswizardry
37
3.5k
Agile that works and the tools we love
rasmusluckow
331
21k
Cheating the UX When There Is Nothing More to Optimize - PixelPioneers
stephaniewalter
285
14k
ピンチをチャンスに:未来をつくるプロダクトロードマップ #pmconf2020
aki_iinuma
128
54k
How To Stay Up To Date on Web Technology
chriscoyier
791
250k
Chrome DevTools: State of the Union 2024 - Debugging React & Beyond
addyosmani
9
1k
A better future with KSS
kneath
240
18k
GraphQLの誤解/rethinking-graphql
sonatard
73
11k
[RailsConf 2023] Rails as a piece of cake
palkan
58
6.1k
We Have a Design System, Now What?
morganepeng
54
7.9k
Responsive Adventures: Dirty Tricks From The Dark Corners of Front-End
smashingmag
253
22k
No one is an island. Learnings from fostering a developers community.
thoeni
21
3.5k
Transcript
⼈流データを⽤いた⼈流制限 解除後のCOVID-19感染状況 の推定 ⼭形 賴之,鷹⾒ 竣希,⼤⻄ 正輝 国⽴研究開発法⼈ 産業技術総合研究所 ⼈⼯知能学会合同研究会
データ指向構成マイニングとシミュレーション研究会
GPSデータによるCOVID19感染モデル ⼈⼯知能研究センター社会知能チームを中⼼に開発中 • 個⼈単位の移動データを⽤いたモデル 開発中 • 集計量(県内移動・県間移動)によるモデル ← 今⽇紹介
項⽬ 1. 使⽤データと前処理 2. 実⾏再⽣産数と県内平均移動距離の相関 3. 感染モデル 4. パラメーターのベイズ推定 5.
⼈流再開後の総重症者数・死亡者数の推定 6. 考察
使⽤データ • GPSデバイスの位置情報(Blog Watcher社) アプリ識別番号, デバイス識別番号, 経度, 緯度, 時刻 •
確認陽性者数(NHK) • 感染者個票データ(クラスター追跡班) • 全ての期間にわたるデータではない • 発症から報告までの時間差を推定するために使⽤
東京都の感染インシ デント数 報告陽性者数 → (Back projection) → 発症者数 → (Back
projection) → 感染インシデント数 報告遅れ:個票データの報告遅れに対数 正規分布を当てはめ 潜伏期間:Lauer et al.
都内の平均移動距離 GPSデバイスの平均移動距離 2020年1⽉15⽇-2⽉15⽇を0とした変化 量
東京都への来訪者数
実⾏再⽣産数と都内 移動 R^2 = 0.2781
𝑅! , α, 𝑅" , 𝐷はベイズ的に推定する 𝑀: 平均移動距離, 𝑉 #
: p県からの来訪者数, P# :p県の人口, gt 𝑘 : 生成時間分布, 𝐼# 𝑑 : p県のd日目の新規感染者 数 𝐼$%&'% 𝑑 ~NegBinomial(𝐸[𝐼$%&'% 𝑑] , 𝐷) 𝑅()) 𝑑 = 𝑅! + 𝛼 𝑀 𝑑 𝐼 ()) # 𝑑 = @ *+, - gt 𝑘 𝐼#[𝑑 − 𝑘] 𝐸[𝐼$%&'% 𝑑] = 𝑅()) 𝑑 𝐼 ()) $%&'% 𝑑 + 𝑅" @ #.$%&'% 𝑉 # 𝑃# 𝐼 ()) # 𝑑
推定された𝑅C , α, 𝑅D , 𝐷 2.5%分位 25%分位 中央値 75%分位
97.5%分 位 𝑅! 1.19 1.27 1.31 1.35 1.43 α 0.42 0.60 0.69 0.78 0.95 𝑅" 0.00 0.02 0.06 0.11 0.28 𝐷 15.52 18.00 19.42 20.95 24.10
データへの適合 得られたパラメータをもとに2020年4⽉1 ⽇から1000回シミュレーションを⾏った • 実線:感染⽇ベースの感染者数 • 点線:シミュレーション出⼒の中央値 • 濃いグレー:50% •
薄いグレー:95%
⼈流制限解除の条件を検討する ⼈流がCOVID-19以前に戻った場合 • 感染爆発は防げるか • 感染爆発が起きた場合、医療資源はどの程度必要か • 時系列予測ではなく、最終的な総感染者数を予測する
ワクチン効果減衰 Chemaitelly H, Tang P, Hasan MR, AlMukdad S, Yassine
HM, Benslimane FM, et al. Waning of BNT162b2 Vaccine Protection against SARS-CoV-2 Infection in Qatar. N Engl J Med. 2021;1‒15.
重症化予防効果 ほぼ⼀定している
想定 • ⼈流以外の対策(マスク着⽤)などは現在と同じ • δ株は再⽣産数は従来型の2倍 Rb = 2 x 1.31
• ワクチン接種率: 65歳以下 80%, 65歳以上90% • ワクチンによる感染予防効果: 50% (半年に⼀回ブースター) • ⼈流制限解除時の罹患率が5% • 陽性確定者の重症化率: 0.003(65歳以下), 0.085(65歳以上) • 陽性確定者の死亡率:0.0006(65歳以下), 0.057(65歳以上) • ワクチンの重症化・死亡防⽌効果:95% • 感染者の発⾒率: 50% • 感染後の免疫は維持される
決定論的2集団SIRモ デル Magal, Pierre, Ousmane Seydi, and Glenn Webb. "Final
size of a multi- group SIR epidemic model: Irreducible and non-irreducible modes of transmission." Mathematical biosciences 301 (2018): 59-67.
感染者数 65歳以下 65歳以上 ワクチン接種済み 3,895,242 1,334,462 ワクチン接種なし 1,483,164 225,828 総感染者数:6,938,697
重症者数 総重症者数:14,951 65歳以下 65歳以上 ワクチン接種済み 292 2835 ワクチン接種なし 2225 9598
死亡者数 総重症者数:8842 65歳以下 65歳以上 ワクチン接種済み 58 1902 ワクチン接種なし 445 6436