Webinar: Análisis de datos ómicos de nueva generación scRNA-seq

Single-cell transcriptomics: Análisis de datos ómicos de nueva generación
scRNA-seq

La presentación corresponde al Webinar trasmitido el 27 de Agosto del 2026 en colaboración entre El Arkhe Multiomics (Mx) y BioMaster (Perú).

La charla tiene como objetivo hablar de los fundamentos de la transcriptómica de célula única (scRNA-seq), sus principales aplicaciones científicas y una introducción al análisis bioinformático.
Además, se presentan distintas opciones para desarrollar habilidades en el análisis bioinformático de datos de célula única en LATAM, incluyendo oportunidades de formación para quienes buscan especializarse en esta área de rápido crecimiento dentro de la genómica y las ciencias de la vida.

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Transcript

1. Análisis de datos ómicos de nueva generación scRNA-seq Presenta Dra. Cynthia Soto Cardinault Consultora en análisis de datos multi-ómicos Fundadora de “El Arkhe Multiomics” Agosto 2026
2. Esquema de la charla ¿ Qué es scRNA-seq ? ¿ Qué hace tan interesante a esta tecnología ? ¿ Cómo se analizan datos scRNA-seq en un proyecto real ? ¿ Cómo se mueve single-cell en Latinoamérica ? ¿ Cómo arrancamos con scRNA-seq ? 2
3. (1) ¿Qué es scRNA-seq ? 3
4. Single-Cell RNA sequencing o secuenciación de ARN de célula única: scRNA-seq (1) Una tecnología que permite medir la expresión génica célula por célula (2) Una técnica de laboratorio que mide qué genes están activos en cada célula (3) Permite determinar la función exacta de cada célula Perfiles transcriptómico a nivel de célula única 4
5. Evolución histórica • La amplificación del transcriptoma completo (WTA) (90s) • La secuenciación de nueva generación (NGS) (2000s) 5
6. Continúa … 6
7. Transcriptómica global y de célula única Dos escalas para estudiar la expresión génica 7
8. (2) ¿ Qué hace tan interesante a scRNA-seq ? 8
9. La biología a resolución unicelular Heterogeneidad Celular Estados Transicionales Células Raras Trayectorias Dinámicas 9
10. Aplicaciones scRNA-seq 10
11. Descubrimientos emblemáticos Atlas celular de la malaria (2019) Anopheles stephensi Mosquito Plasmodium berghei, un modelo de malaria en roedores (Hígado y sangre del hospedero) Howick VM, Russell AJC, Andrews T, et al. 2019 (Science) 11
12. Descubrimientos emblemáticos Atlas celular de la mosca (2022) Drosophila melanogaster Mosca de la fruta Hongjie Li et al. 2022 (Science) 12
13. Descubrimientos emblemáticos Atlas Celular Humano (2017-2024) Rood, J.E., Wynne, S., Robson, L. et al. 2024 (Nature) 13
14. Las Multiómicas Inayatullah et al. - Current Opinion in Cell Biology - 2025 Chen et al. - Frontiers in Genetics (2024) 14
15. Single-cell … “es presente” Chen et al. - Frontiers in Genetics (2024) 15
16. (3) ¿ Cómo se analizan datos scRNA-seq en un proyecto real ? Caso de estudio Habénula Humana 16
17. Atlas de la Habénula Humana Análisis de datos: Multiome & Visium: Cynthia S. Visium HD: Nick E., Chunyu L., Brion M. PAs: Leonardo Collado Kristen Maynard Manuscrito en desarrollo - no publicado aún 17
18. Cell-Ranger (Pre-procesamiento) 1 1 Métricas de control de calidad (RNA) 3 Identificación de células reales 2 18
19. 4 Integración WNN: (LSI/Harmony) 11 5 6 Anotación-Inicial: marcadores moleculares e Interpretación funcional Comparación de clustering (ARI) Hacer scRNA-seq … es seguir un flujo bioinformático estructurado Validación interna: Silhouette score 10 Estabilidad/jerarquía de clusters 9 8 7 Expresión diferencial. Referencias externas/spatial mapping 19
20. Analizar datos scRNA-seq implica tomar decisiones 20
21. Las metodologías (pipelines) automatizadas en la nube funcionan? Contras Pros 1. 2. 3. Rapidez y reproducibilidad Menor barrera técnica Escalabilidad 1. 2. 3. Menor control Menor capacidad de validación Riesgo de “caja negra” 21
22. Sesión de preguntas El Arkhe Multiomics México | BioMaster Perú Agosto 27, 2026 22