JATS-Con 2019

学術情報XML推進協議会セミナー日時
：2019年8月2日（金曜日）16:30 – 17:00
場所：DMZ WORK

Transcript

1. 1 2019/8/2 XSPA 時実 象一 tokizane@pc.highway.ne.jp JATS-Con 2019
2. JATS-Con とは • JATS の技術と開発に関する国際会議 – NCBI/NIH が主催 – 2010 年に第1回、原則毎年1回 – Bethesda の NLM で開催 – XSPA からも発表 (時実、中西) – 2019 年は例外的に英国で開催 • Wellcome Genome Center 会議場 (Cambridge 郊外) 2
4. MECA 研究機関 ID (ROR) JATS4R JATS 2.0 JATS 関連プロジェクト
5. MECA (Manuscript Exchange Common Approach) • ある雑誌で投稿が不採択となった際、その 投稿データを他の雑誌の投稿システムに転 送する仕組み • 2016年8月: Common Approach to Manuscript Transferワーキンググループを 結成 • 2017年: MECAに改称 • 2018年4月: NISO • 2018年9月: NISOのワーキング・グループ で、MECAを推奨基準とみなす 5
6. • MECA の採用 – Aries Editorial Manager / ProduXion Manager – eJournalPress – Highwire 6
7. Research Organization Registry (ROR) • 研究機関の名称や各種識別子の台帳 – 2019年中にリリース予定 • 投稿システムにROR APIをインストール – 入力した機関名に対して、候補がプルダウンで表示 – 選択すると自動的にRORが付与 • RORのレコード – https://ror.org/03yrm5c26のような形 – ROR ID: 03yrm5c26 (最後の数字はチェック文字) – 機関名、その略記、他言語の標記、ウェブサイト、他の 識別子 (GRID, ISNI, Wikidataなど)、その他のメタデー タ (所在地情報、関連レコードなど) が記述 • RORはJATSの <institution-id> で記述 7
8. JATS4R • Melissa Harrison (Head of Production Operations, eLife;JATS4R) • JATS4R (JATS for Reuse) とは – JATS は記述の仕方に任意性が高い – 出版者によって書き方が異なる – これをなるべく標準化するための推奨基準を 作成する 8
9. • これまでの提言 – 出版日付 – 著者名と所属機関 – 一般 – 引用文献 – 臨床試験 – 利益相反 – CRediT – データ引用 – データ入手可能性 – 数式 – 許諾 – 主題とキーワード 9
10. JATS 2.0 • JATS 2.0 を検討 – JATS 1.x とは非互換 – JATS 1.x が引き継いでいるレガシーを削除し てきれいにする – 例 • NLM Citation の削除 – JATS 1.x は並行してサポートする 10
11. BioArxv PLOS Crossref 招待講演
12. bioRxiv • Richard Sever (Co-Founder, bioRxiv; Assistant Director, CSHL Press) • bioRxivは2013年にCold Spring Harbor Laboratoryが設立したプレプリント・サイト • 非営利で、投稿費、アクセス費ともに無料 • スクリーニングはおこなうが査読は行わない – 意味があるか – 科学であるか – 研究論文か – 剽窃はないか – 医学か 12
13. • 48,000件以上の論文 • 30%が1回以上改訂 • 200,000著者 • 4,000,000回/月の閲覧 • 70%以上が後日雑誌論文として出版される • 1900雑誌がbioRxivプレプリントを出版 13
16. PLOS • Emma Ganley (Chief Editor, PLOS Biology) • PLOSは2001年設立 – 元NIH所長のHarld Varmusなど – オープンアクセス出版者として設立 • 2006年にPLOS ONEを創刊 – ビジネス的にも大きな成功 16
17. • すべてのPLOS雑誌で、査読結果通知と すべての査読結果 (査読者名は任意)、著 者の回答、を公開 – 2019年5月22日より • これらにはDOIも付与 • 公開は著者が選択 – 査読者が名前が出るのを恐れて、署名をし なくなる可能性はある – 査読の品質は向上すると思われる 17
18. • 2014年3月にPLOS Data Policyを公表 • 全ての論文はData Availability Statement (DAS) を付記しなくてはならない 18
19. • データ公開の例外 – 倫理的または法的な問題 患者等の個人情報の 暴露等 – その他の危険 動植物の生息地の公開による乱 獲の恐れ、など • 2014年3月以降、PLOSでは115,000論文を 出版 – DASが提出されないことによる拒絶は0.1%以 下 – 25%がデータ・リポジトリを利用 19
20. Crossref • Patricia Feeney (Head of Metadata, Crossref) • Crossref が1999年に発足した際の必須メ タデータ – DOI – URL – 雑誌名 – ISSN – 巻・号 – 先頭ページ、最終ページ – 記事タイトルや著者名すら必須ではなかった • その後Crossrefは順次範囲は広げてきてお り、2019年には研究助成ID、会議IDも追 加される予定。 20
21. • CrossrefのXMLはもともとJATSと異なる • JATSデータはJATS-to-Crossref XSLTで処 理 • 長期的には、JATSを直接入力に使うこと も検討 21
22. 2020/4/28-29 NLM, Bethesda, MD, USA 次回 JATS-Con