JATS-Con 2019

学術情報XML推進協議会セミナー日時
：2019年8月2日（金曜日）16:30 – 17:00
場所：DMZ WORK

Transcript

1. 1
   2019/8/2 XSPA
   時実 象一
   tokizane@pc.highway.ne.jp
   JATS-Con 2019
   

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2. JATS-Con とは
   • JATS の技術と開発に関する国際会議
   – NCBI/NIH が主催
   – 2010 年に第1回、原則毎年1回
   – Bethesda の NLM で開催
   – XSPA からも発表 (時実、中西)
   – 2019 年は例外的に英国で開催
   • Wellcome Genome Center 会議場 (Cambridge 郊外)
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4. MECA
   研究機関 ID (ROR)
   JATS4R
   JATS 2.0
   JATS 関連プロジェクト
   

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5. MECA (Manuscript Exchange Common
   Approach)
   • ある雑誌で投稿が不採択となった際、その
   投稿データを他の雑誌の投稿システムに転
   送する仕組み
   • 2016年8月: Common Approach to
   Manuscript Transferワーキンググループを
   結成
   • 2017年: MECAに改称
   • 2018年4月: NISO
   • 2018年9月: NISOのワーキング・グループ
   で、MECAを推奨基準とみなす 5
   

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6. • MECA の採用
   – Aries Editorial Manager / ProduXion Manager
   – eJournalPress
   – Highwire
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7. Research Organization Registry (ROR)
   • 研究機関の名称や各種識別子の台帳
   – 2019年中にリリース予定
   • 投稿システムにROR APIをインストール
   – 入力した機関名に対して、候補がプルダウンで表示
   – 選択すると自動的にRORが付与
   • RORのレコード
   – https://ror.org/03yrm5c26のような形
   – ROR ID: 03yrm5c26 (最後の数字はチェック文字)
   – 機関名、その略記、他言語の標記、ウェブサイト、他の
   識別子 (GRID, ISNI, Wikidataなど)、その他のメタデー
   タ (所在地情報、関連レコードなど) が記述
   • RORはJATSの で記述 7
   

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8. JATS4R
   • Melissa Harrison (Head of Production Operations,
   eLife;JATS4R)
   • JATS4R (JATS for Reuse) とは
   – JATS は記述の仕方に任意性が高い
   – 出版者によって書き方が異なる
   – これをなるべく標準化するための推奨基準を
   作成する
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9. • これまでの提言
   – 出版日付
   – 著者名と所属機関
   – 一般
   – 引用文献
   – 臨床試験
   – 利益相反
   – CRediT
   – データ引用
   – データ入手可能性
   – 数式
   – 許諾
   – 主題とキーワード
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10. JATS 2.0
    • JATS 2.0 を検討
    – JATS 1.x とは非互換
    – JATS 1.x が引き継いでいるレガシーを削除し
    てきれいにする
    – 例
    • NLM Citation の削除
    – JATS 1.x は並行してサポートする
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11. BioArxv
    PLOS
    Crossref
    招待講演
    

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12. bioRxiv
    • Richard Sever (Co-Founder, bioRxiv; Assistant Director, CSHL
    Press)
    • bioRxivは2013年にCold Spring Harbor
    Laboratoryが設立したプレプリント・サイト
    • 非営利で、投稿費、アクセス費ともに無料
    • スクリーニングはおこなうが査読は行わない
    – 意味があるか
    – 科学であるか
    – 研究論文か
    – 剽窃はないか
    – 医学か 12
    

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13. • 48,000件以上の論文
    • 30%が1回以上改訂
    • 200,000著者
    • 4,000,000回/月の閲覧
    • 70%以上が後日雑誌論文として出版される
    • 1900雑誌がbioRxivプレプリントを出版
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16. PLOS
    • Emma Ganley (Chief Editor, PLOS Biology)
    • PLOSは2001年設立
    – 元NIH所長のHarld Varmusなど
    – オープンアクセス出版者として設立
    • 2006年にPLOS ONEを創刊
    – ビジネス的にも大きな成功
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17. • すべてのPLOS雑誌で、査読結果通知と
    すべての査読結果 (査読者名は任意)、著
    者の回答、を公開
    – 2019年5月22日より
    • これらにはDOIも付与
    • 公開は著者が選択
    – 査読者が名前が出るのを恐れて、署名をし
    なくなる可能性はある
    – 査読の品質は向上すると思われる
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18. • 2014年3月にPLOS Data Policyを公表
    • 全ての論文はData Availability Statement
    (DAS) を付記しなくてはならない
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19. • データ公開の例外
    – 倫理的または法的な問題 患者等の個人情報の
    暴露等
    – その他の危険 動植物の生息地の公開による乱
    獲の恐れ、など
    • 2014年3月以降、PLOSでは115,000論文を
    出版
    – DASが提出されないことによる拒絶は0.1%以
    下
    – 25%がデータ・リポジトリを利用
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20. Crossref
    • Patricia Feeney (Head of Metadata, Crossref)
    • Crossref が1999年に発足した際の必須メ
    タデータ
    – DOI
    – URL
    – 雑誌名
    – ISSN
    – 巻・号
    – 先頭ページ、最終ページ
    – 記事タイトルや著者名すら必須ではなかった
    • その後Crossrefは順次範囲は広げてきてお
    り、2019年には研究助成ID、会議IDも追
    加される予定。
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21. • CrossrefのXMLはもともとJATSと異なる
    • JATSデータはJATS-to-Crossref XSLTで処
    理
    • 長期的には、JATSを直接入力に使うこと
    も検討
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22. 2020/4/28-29
    NLM, Bethesda, MD, USA
    次回 JATS-Con
    

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