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JATS-Con 2019

XSPA
August 02, 2019

JATS-Con 2019

学術情報XML推進協議会セミナー日時
:2019年8月2日(金曜日)16:30 – 17:00
場所:DMZ WORK

XSPA

August 02, 2019
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Transcript

  1. 1
    2019/8/2 XSPA
    時実 象一
    [email protected]
    JATS-Con 2019

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  2. JATS-Con とは
    • JATS の技術と開発に関する国際会議
    – NCBI/NIH が主催
    – 2010 年に第1回、原則毎年1回
    – Bethesda の NLM で開催
    – XSPA からも発表 (時実、中西)
    – 2019 年は例外的に英国で開催
    • Wellcome Genome Center 会議場 (Cambridge 郊外)
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  3. 3

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  4. MECA
    研究機関 ID (ROR)
    JATS4R
    JATS 2.0
    JATS 関連プロジェクト

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  5. MECA (Manuscript Exchange Common
    Approach)
    • ある雑誌で投稿が不採択となった際、その
    投稿データを他の雑誌の投稿システムに転
    送する仕組み
    • 2016年8月: Common Approach to
    Manuscript Transferワーキンググループを
    結成
    • 2017年: MECAに改称
    • 2018年4月: NISO
    • 2018年9月: NISOのワーキング・グループ
    で、MECAを推奨基準とみなす 5

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  6. • MECA の採用
    – Aries Editorial Manager / ProduXion Manager
    – eJournalPress
    – Highwire
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  7. Research Organization Registry (ROR)
    • 研究機関の名称や各種識別子の台帳
    – 2019年中にリリース予定
    • 投稿システムにROR APIをインストール
    – 入力した機関名に対して、候補がプルダウンで表示
    – 選択すると自動的にRORが付与
    • RORのレコード
    – https://ror.org/03yrm5c26のような形
    – ROR ID: 03yrm5c26 (最後の数字はチェック文字)
    – 機関名、その略記、他言語の標記、ウェブサイト、他の
    識別子 (GRID, ISNI, Wikidataなど)、その他のメタデー
    タ (所在地情報、関連レコードなど) が記述
    • RORはJATSの で記述 7

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  8. JATS4R
    • Melissa Harrison (Head of Production Operations,
    eLife;JATS4R)
    • JATS4R (JATS for Reuse) とは
    – JATS は記述の仕方に任意性が高い
    – 出版者によって書き方が異なる
    – これをなるべく標準化するための推奨基準を
    作成する
    8

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  9. • これまでの提言
    – 出版日付
    – 著者名と所属機関
    – 一般
    – 引用文献
    – 臨床試験
    – 利益相反
    – CRediT
    – データ引用
    – データ入手可能性
    – 数式
    – 許諾
    – 主題とキーワード
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  10. JATS 2.0
    • JATS 2.0 を検討
    – JATS 1.x とは非互換
    – JATS 1.x が引き継いでいるレガシーを削除し
    てきれいにする
    – 例
    • NLM Citation の削除
    – JATS 1.x は並行してサポートする
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  11. BioArxv
    PLOS
    Crossref
    招待講演

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  12. bioRxiv
    • Richard Sever (Co-Founder, bioRxiv; Assistant Director, CSHL
    Press)
    • bioRxivは2013年にCold Spring Harbor
    Laboratoryが設立したプレプリント・サイト
    • 非営利で、投稿費、アクセス費ともに無料
    • スクリーニングはおこなうが査読は行わない
    – 意味があるか
    – 科学であるか
    – 研究論文か
    – 剽窃はないか
    – 医学か 12

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  13. • 48,000件以上の論文
    • 30%が1回以上改訂
    • 200,000著者
    • 4,000,000回/月の閲覧
    • 70%以上が後日雑誌論文として出版される
    • 1900雑誌がbioRxivプレプリントを出版
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  14. 14

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  15. 15

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  16. PLOS
    • Emma Ganley (Chief Editor, PLOS Biology)
    • PLOSは2001年設立
    – 元NIH所長のHarld Varmusなど
    – オープンアクセス出版者として設立
    • 2006年にPLOS ONEを創刊
    – ビジネス的にも大きな成功
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  17. • すべてのPLOS雑誌で、査読結果通知と
    すべての査読結果 (査読者名は任意)、著
    者の回答、を公開
    – 2019年5月22日より
    • これらにはDOIも付与
    • 公開は著者が選択
    – 査読者が名前が出るのを恐れて、署名をし
    なくなる可能性はある
    – 査読の品質は向上すると思われる
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  18. • 2014年3月にPLOS Data Policyを公表
    • 全ての論文はData Availability Statement
    (DAS) を付記しなくてはならない
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  19. • データ公開の例外
    – 倫理的または法的な問題 患者等の個人情報の
    暴露等
    – その他の危険 動植物の生息地の公開による乱
    獲の恐れ、など
    • 2014年3月以降、PLOSでは115,000論文を
    出版
    – DASが提出されないことによる拒絶は0.1%以

    – 25%がデータ・リポジトリを利用
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  20. Crossref
    • Patricia Feeney (Head of Metadata, Crossref)
    • Crossref が1999年に発足した際の必須メ
    タデータ
    – DOI
    – URL
    – 雑誌名
    – ISSN
    – 巻・号
    – 先頭ページ、最終ページ
    – 記事タイトルや著者名すら必須ではなかった
    • その後Crossrefは順次範囲は広げてきてお
    り、2019年には研究助成ID、会議IDも追
    加される予定。
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  21. • CrossrefのXMLはもともとJATSと異なる
    • JATSデータはJATS-to-Crossref XSLTで処

    • 長期的には、JATSを直接入力に使うこと
    も検討
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  22. 2020/4/28-29
    NLM, Bethesda, MD, USA
    次回 JATS-Con

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