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Elix, CBI 2021, フォーカストセッション, はじめてのAI創薬とElixにおけ...
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October 28, 2021
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370
Elix, CBI 2021, フォーカストセッション, はじめてのAI創薬とElixにおける事例紹介
Elix
October 28, 2021
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Transcript
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$PQZSJHIU&MJY *OD"MMSJHIUTSFTFSWFE Խֶۭؒ 4 Chemical space of drug-like molecules (ʙ1060)
CAS database (ʙ108)
3FTUSJDUFE&MJY *OD ࢠઃܭ 5 Image Source: Sanchez-Lengeling et al. (2018)
Drug-likeͳࢠʙ1060ݸ ࣮ݧ/γϛϡϨʔγϣϯ ༧ଌϞσϧ ੜϞσϧ
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Suggest Promising Molecules Suggest Synthetic Routes Elix Create Elix Synthesize Properties Model Model Model
3FTUSJDUFE&MJY *OD Α͘༻͍ΒΕΔදݱํ๏ 7 Fingerprint SMILES Graph Image Source: Meter
& Coote (2019), Schwalbe-Koda & Gómez-Bombarelli (2019)
ಛʹΑ͘༻͍ΒΕΔදݱํ๏ 8 • Fingerprint • ༷ʑͳछྨ͕ଘࡏ͢Δ͕ECFPͳͲ͕ಛʹ༗໊ • ֤Ϗοτ͕ಛఆͷߏʹରԠ • Collision͕ى͖ͯ͠·͏Մೳੑ͕͋Δ
• InvertibleͰͳ͍ • SMILES • Խ߹Λจࣈྻͱͯ͠දݱ • ҰͭͷԽ߹ʹରͯ͠Ұҙʹܾ·Βͳ͍ • Θ͔ͣʹҟͳΔԽ߹SMILESͱͯ͠େ͖͘มΘͬͯ͠·͏߹ ʢԽ߹ͷsimilarityΛදݱ͢ΔΑ͏ʹσβΠϯ͞Ε͍ͯͳ͍ʣ • Graph • Խ߹ΛϊʔυΛΤοδͱͯ͠දݱ • ࣗવͳදݱํ๏ʹࢥ͑Δ Image Source: Jin et al. (2018)
༷ʑͳ༧ଌϞσϧ 9 Wu et al. (2017) άϥϑϕʔεͷϞσϧͷํ͕ྑ͍݁Ռ͕Ͱ͋Δ͜ͱ͕ଟ͍͕ɺ༏ҐͳϞσϧλεΫʹΑͬͯมΘΔ
$BTF4UVEZ $07*%࣏ྍༀީิͷ୳ࡧ
$BTF4UVEZ$07*% 11 💊 Identi fi ed Drug Candidates Using AI
https://arxiv.org/abs/2006.06523 Paper Media Active/Inactive Model FDA Approved Drugs Drug Repositioning
λʔήοτͱσʔλ 12 • σʔληοτΛͲ͏͢Δ͔͕ • ৽͍͠ΠϧεͳͷͰ׆ੑʹؔ͢Δσʔλવͳ͍ • RNA dependent RNA
polymerase (RdRp) • ΄ͱΜͲͷRNAΠϧεͰଘࡏ͍ͯ͠Δ • ׆ੑ෦Ґͷߏ͕ҟͳΔΠϧεͰࣅ͍ͯΔ • HCVɺϙϦΦΠϧεɺσϯάΠϧεɺΠϯϑϧΤϯβΠϧεͷRdRp ʹର͢Δ્׆ੑσʔλΛར༻Ͱ͖Δ • ਓମʹରԠ͢Δͷ͕ଘࡏ͠ͳ͍ͨΊɺ෭࡞༻͕ੜ͡ΔϦεΫΛܰݮ
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