Upgrade to Pro
— share decks privately, control downloads, hide ads and more …
Speaker Deck
Features
Speaker Deck
PRO
Sign in
Sign up for free
Search
Search
気胸の胸部CTデータの可視化
Search
puripuri2100
January 16, 2024
Technology
0
310
気胸の胸部CTデータの可視化
筑波大学情報科学類で開講された2023年度の情報特別演習の最終発表会で使用したスライドです
puripuri2100
January 16, 2024
Tweet
Share
More Decks by puripuri2100
See All by puripuri2100
法律文書の自動解析2024
puripuri2100
0
66
絵文字は構文解析できるのか
puripuri2100
0
96
係り受け解析を用いた法律文書中の略称規定の解析についての報告
puripuri2100
0
3.1k
SATySFiで作成する構文解析器
puripuri2100
0
270
SATySFiの開発についての要望
puripuri2100
0
450
研究の場においてのRust 製ソフトウェアのバージョン管理について
puripuri2100
0
630
法律文書の自動解析
puripuri2100
1
940
汎用的なコードフォーマットライブラリの作成
puripuri2100
0
330
ユーザーがカスタマイズできるクラスファイル ―v0.0.x と v0.1.x それぞれでの実装 ―
puripuri2100
0
380
Other Decks in Technology
See All in Technology
「使いにくい」も「運用疲れ」も卒業する UIデザイナーとエンジニアが創る持続可能な内製開発
nrinetcom
PRO
1
780
名刺メーカーDevグループ 紹介資料
sansan33
PRO
0
1.1k
Agentic Software Modernization - Back to the Roots (Zürich Agentic Coding and Architectures, März 2026)
feststelltaste
1
170
研究開発部メンバーの働き⽅ / Sansan R&D Profile
sansan33
PRO
4
22k
大規模サービスにおける レガシーコードからReactへの移行
magicpod
1
130
作るべきものと向き合う - ecspresso 8年間の開発史から学ぶ技術選定 / 技術選定con findy 2026
fujiwara3
7
2.1k
開発組織の課題解決を加速するための権限委譲 -する側、される側としての向き合い方-
daitasu
4
250
どこで打鍵するのが良い? IaCの実行基盤選定について
nrinetcom
PRO
2
170
Exadata Fleet Update
oracle4engineer
PRO
0
1.3k
製造業ドメインにおける LLMプロダクト構築: 複雑な文脈へのアプローチ
caddi_eng
1
460
GitLab Duo Agent Platform + Local LLMサービングで幸せになりたい
jyoshise
0
110
組織のSREを推進するためのPlatform EngineeringとEKS / Platform Engineering and EKS to drive SRE in your organization
chmikata
0
180
Featured
See All Featured
The Cult of Friendly URLs
andyhume
79
6.8k
The Impact of AI in SEO - AI Overviews June 2024 Edition
aleyda
5
760
GraphQLとの向き合い方2022年版
quramy
50
14k
Save Time (by Creating Custom Rails Generators)
garrettdimon
PRO
32
2.3k
What's in a price? How to price your products and services
michaelherold
247
13k
Visual Storytelling: How to be a Superhuman Communicator
reverentgeek
2
460
Site-Speed That Sticks
csswizardry
13
1.1k
Producing Creativity
orderedlist
PRO
348
40k
JavaScript: Past, Present, and Future - NDC Porto 2020
reverentgeek
52
5.9k
The Invisible Side of Design
smashingmag
302
51k
Chasing Engaging Ingredients in Design
codingconduct
0
130
Jamie Indigo - Trashchat’s Guide to Black Boxes: Technical SEO Tactics for LLMs
techseoconnect
PRO
0
80
Transcript
気胸の胸部 CT データの可視化 puripuri2100 2024-01-16 筑波大学情報科学類 情報特別演習 最終発表会
1/6 気胸とは 肺に穴があく病気 肺がしぼみ、呼吸がしにくくなる 死ぬ可能性は低いが、日常生活に大きな支障が出る 具体的には運動が一切できない
1/6 気胸とは 肺に穴があく病気 肺がしぼみ、呼吸がしにくくなる 死ぬ可能性は低いが、日常生活に大きな支障が出る 具体的には運動が一切できない 1 年生の春にこれになりました
1/6 気胸とは 肺に穴があく病気 肺がしぼみ、呼吸がしにくくなる 死ぬ可能性は低いが、日常生活に大きな支障が出る 具体的には運動が一切できない 1 年生の春にこれになりました なんとか夏休み前までに治ったものの、まだ肺活量は少ないまま
2/6 自分の肺が見たい! しかし空いてしまったものはしょうがない
2/6 自分の肺が見たい! しかし空いてしまったものはしょうがない しぼんでいた肺を見たくないですか?
2/6 自分の肺が見たい! しかし空いてしまったものはしょうがない しぼんでいた肺を見たくないですか? めちゃくちゃ見たい!
2/6 自分の肺が見たい! しかし空いてしまったものはしょうがない しぼんでいた肺を見たくないですか? めちゃくちゃ見たい! 治癒の過程を実感を持って振り返りたい 自分の身体の中身を 3D グラフィックで詳細に見てみたい せっかく自由に使える面白いデータがあるのだから触ってみたい
2/6 自分の肺が見たい! しかし空いてしまったものはしょうがない しぼんでいた肺を見たくないですか? めちゃくちゃ見たい! 治癒の過程を実感を持って振り返りたい 自分の身体の中身を 3D グラフィックで詳細に見てみたい せっかく自由に使える面白いデータがあるのだから触ってみたい
肺の 3D モデルを生成してくれるソフトウェアを作成!
2/6 自分の肺が見たい! しかし空いてしまったものはしょうがない しぼんでいた肺を見たくないですか? めちゃくちゃ見たい! 治癒の過程を実感を持って振り返りたい 自分の身体の中身を 3D グラフィックで詳細に見てみたい せっかく自由に使える面白いデータがあるのだから触ってみたい
肺の 3D モデルを生成してくれるソフトウェアを作成!
3/6 「肺のデータ」 を入手 普通のレントゲン画像では情報量が足りなさすぎるので CT スキャンという手法 で撮影されたデータを使う 身体を輪切りにしたようなデータが取れる 筑波大学附属病院に開示請求することでデータを入手 データは
DICOM という医療用画像データの規格だった 簡単に言うと「領域を 500 × 500 × 200 のブロックに分け、それぞれにグレー スケールの値を振る」という形になっている
4/6 データ処理 取得したデータを以下のような形で解析をし、 3D モデルのデータとなる object 形式 ファイルを生成する 1. 「同じ部位ならばほぼ同じ色になる」という前提を利用して、用意した基準値
に近い箇所をまとめてグループ化する 2. 小さなごみを除去する 3. そのままだとファイルサイズが大きくなるのでブロック情報を面情報に変換 4. 生成した面情報をファイルに出力
4/6 データ処理 取得したデータを以下のような形で解析をし、 3D モデルのデータとなる object 形式 ファイルを生成する 1. 「同じ部位ならばほぼ同じ色になる」という前提を利用して、用意した基準値
に近い箇所をまとめてグループ化する 2. 小さなごみを除去する 3. そのままだとファイルサイズが大きくなるのでブロック情報を面情報に変換 4. 生成した面情報をファイルに出力
5/6 描画
5/6 描画
5/6 描画 Three.js というライブラリを使って治癒の過程を順に描画: https://puripuri2100.site/vlung/(表示に少々時間がかかります)
6/6 まとめ 自分自身の胸部 CT 画像データから肺の 3D モデルを生成することに成功 作成したソフトウェアやデータは OSS やオープンデータとして公開中
https://puripuri2100.site/vlung https://github.com/puripuri2100/vlung https://github.com/puripuri2100/vlung-analysis https://github.com/puripuri2100/lung Future Works MRI データにも応用させたい 3D プリントしたい ノイズ除去をもっと頑張りたい