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良書紹介04_生命科学の実験デザイン
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ぶんちん
September 04, 2025
Science
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良書紹介04_生命科学の実験デザイン
ぶんちん
September 04, 2025
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Transcript
DS初心者向け 知名度は低いけどオススメの良書紹介4 ~効果的な現実世界のデータ収集~ ぶんちん 2025年9月4日 データサイエンティスト集会 in VRC 1
自己紹介 ぶんちん データサイエンティスト集会の主催 複合経営が特徴の企業(製造業)に所属 データ分析担当者だったが。。。 e ラ
ー ニ ン グ の イ ラ ス ト ( 男 性 ) 困 っ た 顔 で 働 く 会 社 員 の イ ラ ス ト ( 男 性 ) 成果獲得を狙うと、 同じことに繰り返しで 飽きた 他者にやってもらったら、 成果が増えるのでは? 特に非専門家向けの データサイエンス活用教育 2
良い書籍はたくさんあるけど。。。 良書は人気になりやすい 3 人気書籍 知られていない本でも良書がある 今回はそれを紹介
データ収集のデザイン Garbage in, garbage out ⇒『無意味なデータ(ゴミ)』を入力する 『無意味な結果(ゴミ)』が出力される ゴミにならないよう設計していますか? 特に現実世界のデータ取得! 4
丸投げNG
現実世界のデータ取得の難しさ 全てのデータに明確な意図を持った設計が必要 ⇒ 逆に意図しないデータは取得できない どのようなデータを取りたいのか どのように測定するのか どのような条件で記録するのか
どのくらいの期間・量のデータを記録するのか 5 データ取得は高コスト(カネ・時間・手間) ⇒ 追加・変更が困難 なんとなくで条件を決めるのは不適切
データ取得条件を検討する分野はないのか 実験の設計! 6 実験 =未知を明らかにするための 科学的アプローチ方法
生命科学の実験デザイン 「生命科学」とのタイトルだが、分野に関わ らず有用な内容 「実験デザイン」を扱った和書は本書を含め て2冊しか見つからず、どちらもバイオ系 成果を出すための実験(データ取得条件)の 設計に必要な要件を知ることができる
7
目次 1. デザインはなぜ大切か 2. 仮説を明確にする 3. デザインの大枠を選ぶ 4. 個体間のばらつき、反復、サンプリング 5.
偽反復 6. サンプルサイズ、検出力、効果的なデザイン 7. 最もシンプルな実験デザイン―1因子完全ランダム化デザイン 8. 複数の因子をもつ実験―複因子デザイン 9. 完全ランダム化を超えて―ブロックと共変数 10.被験体内デザイン 11.測定―良質なデータをとるために 8 ここにコンセプトが集約 コンセプト ⇒ 具体的対応
誤った思い込み どのようにデータをとるかは重要ではない.統計的 な「応急処置」は必ずあるので,どのようにとった データでも解析はできる. とにかくデータをたくさんとりさえすれば,何かし らおもしろい結果が出てくるし,非常に微妙な効果 でさえも検出できる. 9 現実はそんなに甘くない!
大学(アカデミック)の出版社だけど キレッキレな表現 1.2 貧弱なデザインの害悪 1.2 .1 時間と金の無駄遣い
劣悪な実験デザインで時とエネルギーを無駄遣いするのが愚 かであることは言うまでもない. 10 地に足の着いた話が多く、表現もわかりやすい ⇒基礎統計と並行して学ぶべき本では?
なんで知名度が低い領域なの? 建前:本書の内容は大学での研究(卒論・修論・博 士論文)に取り組む中で、全員が身に着けている 11 本当? • 体系化されて説明されている書籍が少ないのに? • 実験しない人も学んでいる? •
仕事でこの考え方、使えている?
実験デザインの重要性 できているようで、実はできていない領域 課題オーナーに丸投げはNG 成果を出すためには、押さえておく分野 個人的にビジネスでも有用だと思う 12
データ取得のコア部分に 積極的に関与しませんか?