2019-06-space-efficient-graph-search

グラフの省領域探索
StringBeginners: https://sites.google.com/view/stringbeginners/workshop/2019/2019-06-24-aip

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1. グラフの省領域探索 2019/06/24 StringBeginners #6 at AIP @kgoto 0
2. はじめに 1 n“Space Efficient Algorithms for Breadth-Depth Search, Sankardeep Chakraborty, Anish Mukherjee, Srinivasa Rao Satti, acceptted to FCT 2019”の論⽂紹介をします
3. 論⽂の主張 2 nBreadth Depth Search(BDS)とはグラフ探索法の１つ 同じ名前で中⾝が違う２つのアルゴリズムがある pBDShs (Horowitz and Sahni, 1984) pBDSj (Jiang, 1993) n(2つの)BDSのspace-efficientなアルゴリズムを提案した *素朴な⽅法ではO(m + n) time and O(n lg n) bits space必要
4. 計算モデル 3 nread-only memory (ROM) model（⼊⼒を編集することが出 来ない）を仮定する pROM modelは領域を使いたくない、書き込み回数を減らしたい 場⾯に有⽤ • メモリ書き込みに時間がかかる • メモリの耐久性を上げたい n ⼊⼒グラフG=(V, E), n=|V|, m=|E|と表記する, ここでGは隣 接リストの形式で表される（各ノードについて隣接ノード をリストとして持つ、隣接リストは⼦のラベルの昇順に並 んでいるものとする）
5. 今⽇話す話題 4 n提案アルゴリズムのベースとなるBDSjのO(m lg n)時間O(n) bits領域アルゴリズムを説明する （主定理のアルゴリズムはなかなか複雑なので） n論⽂を読んだ限りBDSjは⼦の探索順を逆にした（⼦のラベ ルが⼤きい⽅から順に読む）DFSにしか⾒えませんでした nなので以降はDFSの省領域探索アルゴリズムとして説明し ます。もし、違う点があれば教えてほしいです おことわり
6. DFSのおさらい 5 nrootノードから開始し、各⼦ノードを再帰的に探索、その 際に同じノードを２度辿らないように探索する https://en.wikipedia.org/wiki/Depth-first_search 左の図でrootをA、ラベルの⼤ きい⼦から順に探索すると仮定 すると A, E, F, B, D, C, Gと探索する
7. O(m)時間O(n lg n) bits領域DFSアルゴリズム 6 n準備（使⽤するデータ構造） p各ノードの状態、未探索 or 探索済みをO(n)bitsで管理 pO(n lg n)bitsのスタックで探索順を管理 nアルゴリズム prootノードを探索済みノードに変更しスタックにpush pスタックが空出ない場合、topノードvについて以下の処理を⾏う • if vの⼦供がすべて探索済み – vをスタックからpopし出⼒する • else – vのright-mostな未探索ノードを探索済みノードに変更しスタックにpush ＊素朴なアルゴリズム
8. O(m lg n)時間O(n) bits領域アルゴリズムの概要 7 nボトルネックはスタック領域。 スタックの上部（直近挿⼊要素）n / log n個の要素だけを 陽に保存し（O(n) bits領域）、O(m)時間探索を⾏う n次のtop n / log n個をO(m)時間で復元し同様の処理を⾏う top n / lg n個を陽に保存する。O(n) bits必要 陽に持たない、復元ステップで復元する スタック n O(lg n)回 全体でO(m lg n)時間、O(n) bits領域使⽤する
9. 状態管理 8 n探索ステップの各ノードの３状態をO(n) bitsで保存する pwhite: 未探索 pgray: 探索中（スタックに保存されているノード） pblack: 探索済み（⼦ノードはすべてblack）
10. 探索ステップ 9 nrootノードをgrayノードに変更しスタックにpush top n / lg n個保存し、あぶれた（忘却する）最後のノードをlast nodeとして記憶 nスタックが空でない場合、topノードvについて処理を⾏う pif vの⼦供がすべてblack（⼦供をすべて探索済み） • vをスタックからpopし出⼒する pelse • vのright-mostなwhite（未探索）ノードをgrayノードに変更しスタックにpush nスタックが空の場合探索ステップを終了 探索ステップで少なくともn / lg n個の要素を出⼒する 計算時間はO(m)時間
11. 再構築ステップ 10 nすべてのgrayノードをwhiteノードに変更する nlast nodeがスタックに保存されるまで探索ステップを⾏う 前探索ステップの出⼒ノードに続く スタックのtop n / lg n要素が必ずスタックに保存される なぜか︖通常のDFSを正しく模倣出来ているから。 blackノードは通常のDFS探索で欲しい状態に⾄る前にpopさ れるノード → skipしても状態の再構築（探索順）には影響ない → skipすることで省領域で状態を復元できる
12. より省領域なアルゴリズム（気持ちだけ） 11 nボトルネックはスタックの復元にかかる計算時間 n復元に必要な情報を省領域に保存し⾼速化する pスタックをO(lg n/ lg lg lg n)ブロックに分割、top 2ブロックを陽 に保存し、すべてのブロックの最初と最後の要素を保存する p各ノードについて、color, 所属するブロックID、処理した⼦供の 数（m/nグループに分け、グループIDを記録する） あるブロックを復元する場合 （保存した）最初のノードから探索を⾏い復元する その際に、各ノードがどのブロックに属するかを保存して いるので適切に復元できる