Rの基礎8 作図

Rの基礎8 作図 2020/8/14 Ver. 1.0

Rと作図 Rはパッケージなしでも作図機能が豊富＊http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r/47.html のスクリプトを走らせただけ

基本の散布図: plot plot関数で散布図などを書くことができる plot(x, y)が基本的な使い方となる

散布行列: pairs 行列・データフレームの散布図作成に利用できる pairs(data.frame)で各列間の相関を調べられる＊相関係数はcor(data.frame)で調べられる

ヒストグラム: hist hist関数でヒストグラム（データの分布）を描画できる hist(vector)が基本の形となる

箱ひげ図: boxplot boxplot関数で箱ひげ図（データの分布）を描画できる箱ひげ図: https://ja.wikipedia.org/wiki/%E7%AE%B1%E3%81%B2%E3%81%92%E5%9B%B3 boxplot(vector)が基本の形となる

Rの基礎作図の問題点複雑な描画をするとスクリプトがわかりにくくなる • 高次作図関数と低次作図関数を組み合わせる • plotを重ね合わせる • 描画エリアを分割する等々の複雑な操作が必要

ggplot2パッケージ現代Rでの作図のデファクト・スタンダードやや複雑だが、きれいなグラフが簡単に書ける＊ggplot2 reference: https://ggplot2.tidyverse.org/reference/

ggplot2を使う: ライブラリを読み込む ggplot2 もしくは tidyverse を読み込む • tidyverseにはggplot2が含まれる • tidyverseの他のパッケージをグラフ作成に利用できる

ggplot2の基礎 ggplot関数を使用する ggplot(data.frame, aes(…)) • ggplotの第一引数はデータフレーム • 第二引数にaes関数を置く＊aes: aesthetic、「美的な」の略

ggplot2の基礎: aes関数 aes関数には、x・y軸の指定、色の指定などを入力する irisデータフレームを作図に使う x軸はPetal.Lengthの列 y軸はSepal.Lengthの列線の色はSpeciesの列棒グラフの中などはSpeciesの列で記述する＊iris:
アヤメの花弁、がく片の長さのデータセット。Rでは始めから利用でき、よく用いられる

ggplot2の基礎: geom関数グラフの形はgeom関数で決定する geom_point() geom_line() geom_bar() geom_boxplot() geom_density() geom_quantile() geom_errorbar()
geom_linerange() 点グラフ（散布図）線グラフ棒グラフ箱ひげ図確率密度回帰（四分位幅あり）エラーバーエラーバー（横線なし）

ggplot2の基礎: geom関数の使い方 ggplot関数と＋でつなぐ

まとめ • Rには作図のための関数が準備されている • ggplot2が作図のスタンダードとなっている • ggplot(data.frame, aes())が基本の形 • geom関数でグラフの形を決める

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